RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC2A1P11166 492 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 CD79AP11912 226 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 TUBG1P23258 451 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 NPY4RP50391 375 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RAG2P55895 527 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 LINC00303Q3SY05 128 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 FJX1Q86VR8 437 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 C17orf47Q8NEP4 570 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 FRG2CA6NGY1 282 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SEMG1P04279 462 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 HTR5AP47898 357 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 GRB2P62993 217 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR4C3Q8NH37 302 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR1S1Q8NH92 325 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ENY2Q9NPA8 101 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A1W2PPC4 97 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 GPR157Q5UAW9 335 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 MKXQ8IYA7 352 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 MARC2Q969Z3 335 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 B9D1Q9UPM9 204 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR2F2O95006 317 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 S100PP25815 95 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PNLIPRP2P54317 469 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR2F1Q13607 317 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR6C76A6NM76 312 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 GREM1O60565 184 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 RGS11O94810 467 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 GDF1P27539 372 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC25A1P53007 311 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 GJC3Q8NFK1 279 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR52N5Q8NH56 324 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 NELFAQ9H3P2 528 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRN2-201ENST00000389413 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 CD63P08962 238 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 CORO6Q6QEF8 472 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 LILRB2Q8N423 598 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 AGBL5Q8NDL9 886 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 C3orf49Q96BT1 292 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A1W2PPV9 198 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SIGLEC6O43699 453 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ATG12O94817 140 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 IGHA1P01876 353 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 TK1P04183 234 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 EPHA1P21709 976 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GFERP55789 205 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 RIN1Q13671 783 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ST8SIA1Q92185 356 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SGCZQ96LD1 299 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 BIN3Q9NQY0 253 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC23A1Q9UHI7 598 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 R4GMQ9 66 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ZFPL1O95159 310 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 AAED1Q7RTV5 226 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 HSD17B8Q92506 261 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ABHD1Q96SE0 405 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MMP25Q9NPA2 562 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 CD79BP40259 229 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SSR4P51571 173 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 EBPQ15125 230 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 DOK3Q7L591 496 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ACAD8Q9UKU7 415 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A1W2PS29 197 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms