RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375429.7

NELFE-202, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NELFE, Length 1,584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-202ENST00000375429 PCK2Q16822 640 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 TEX30Q5JUR7 227 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CORO6Q6QEF8 472 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 C22orf34Q6ZV56 151 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 TUBA1AQ71U36 451 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 DPY19L4Q7Z388 723 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 LINC00346Q8IVM7 164 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 ZNF786Q8N393 782 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 GGHQ92820 318 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CDADC1Q9BWV3 514 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 ACTR6Q9GZN1 396 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 ASH2LQ9UBL3 628 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 SPARCP09486 303 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 ATP6V1E1P36543 226 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CSNK2BP67870 215 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 PIGFQ07326 219 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 C17orf78Q8N4C9 275 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 OR52N5Q8NH56 324 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 LRRC46Q96FV0 321 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 KCNN2Q9H2S1 579 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 B3GNT2Q9NY97 397 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 POLR1DQ9Y2S0 133 aa18.03■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CLEC18AA5D8T8 446 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 C12orf71A8MTZ7 269 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CAPZA2P47755 286 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 POU4F2Q12837 409 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 KLHL22Q53GT1 634 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 TIMM23BQ5SRD1 257 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 SLC18B1Q6NT16 456 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CLEC18BQ6UXF7 455 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CDC20BQ86Y33 519 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 CLEC18CQ8NCF0 446 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 OR10A4Q9H209 315 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 NOX3Q9HBY0 568 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 KCNG2Q9UJ96 466 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 LRCH1Q9Y2L9 728 aa18.02■□□□□ 0.48
NELFE-202ENST00000375429 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 J3QRE1 110 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 CCDC159P0C7I6 412 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 CD79AP11912 226 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 ZNF32P17041 273 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 RAB40BQ12829 278 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 AQP6Q13520 282 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 SLC36A2Q495M3 483 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 SYT9Q86SS6 491 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 SLC35F2Q8IXU6 374 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 CCDC36Q8IYA8 594 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 OR52I1Q8NGK6 324 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 OTOSQ8NHW6 89 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 YIPF3Q9GZM5 350 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 COPS3Q9UNS2 423 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 MYRFQ9Y2G1 1151 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 SLC25A15Q9Y619 301 aa18.01■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 PTGES3LE9PB15 166 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 RER1O15258 196 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 TMCC2O75069 709 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 ADRA2AP08913 450 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 CRHBPP24387 322 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 RAB1AP62820 205 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 MVKQ03426 396 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 TAB1Q15750 504 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 P2RY8Q86VZ1 359 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 ZNF540Q8NDQ6 660 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 SSC4DQ8WTU2 575 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 SGCDQ92629 289 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 MAP6Q96JE9 813 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 TBX5Q99593 518 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 RNF121Q9H920 327 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 FKBP14Q9NWM8 211 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 SCN3BQ9NY72 215 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 UBL3O95164 117 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 OR2T7P0C7T2 308 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 ALOX5APP20292 161 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 HOXC12P31275 282 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 PCBD1P61457 104 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 HIST1H3AP68431 136 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 PSG4Q00888 419 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 CFAP77Q6ZQR2 320 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 AHSA2Q719I0 299 aa18■□□□□ 0.47
NELFE-202ENST00000375429 HIST2H3AQ71DI3 136 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms