RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR8H2Q8N162 312 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLEC4FQ8N1N0 589 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNX31Q8N9S9 440 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC26A10Q8NG04 563 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2Z1Q8NG97 314 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 UFD1Q92890 307 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF75AQ96N20 296 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 VPS35Q96QK1 796 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 P2RX4Q99571 388 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 DESI2Q9BSY9 194 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 HIGD2AQ9BW72 106 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSDMCQ9BYG8 508 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CXCL16Q9H2A7 254 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC17A5Q9NRA2 495 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL36GQ9NZH8 169 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNG12Q9UBI6 72 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUN2Q9UH99 717 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 LAMP5Q9UJQ1 280 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 DNPEPQ9ULA0 475 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 B9D1Q9UPM9 204 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 ABCC4O15439 1325 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 MPDZO75970 2070 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 SSH2Q76I76 1423 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CUX2O14529 1486 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 LAMB4A4D0S4 1761 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PNV4 684 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1W2PRV1 198 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 GGTLC3B5MD39 225 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 H3BRN7 92 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 SDHDO14521 159 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTAGE5O15320 804 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSCAO43653 123 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 MGRN1O60291 552 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 OXTP01178 125 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 GZMBP10144 247 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 RRASP10301 218 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 MSR1P21757 451 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF1P41567 113 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEA8P43361 318 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 HCAR3P49019 387 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 TGM4P49221 684 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLA2G16P53816 162 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR5I1Q13606 314 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIP10Q15642 601 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 LUZP6Q538Z0 58 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 SFT2D3Q587I9 215 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 C10orf120Q5SQS8 335 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 THEM4Q5T1C6 240 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAB12Q6IQ22 244 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 H3F3CQ6NXT2 135 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CENPUQ71F23 418 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCF23Q7RTU1 214 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAGE2Q7Z2X7 111 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAF8Q7Z7C8 310 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKRD23Q86SG2 305 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 MOB3BQ86TA1 216 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR8H3Q8N146 312 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CLDN19Q8N6F1 224 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 B3GNT7Q8NFL0 401 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4M1Q8NGD0 313 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR10J6PQ8NGY7 276 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 EXOC6Q8TAG9 804 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 GIPC3Q8TF64 312 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM3CQ92520 227 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBE2E3Q969T4 207 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEH1LQ96EE3 360 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 RARRES2Q99969 163 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 TCHPQ9BT92 498 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRORYQ9H606 182 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 ECT2Q9H8V3 914 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 UFSP2Q9NUQ7 469 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHBDL2Q9NX52 303 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CYP39A1Q9NYL5 469 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 HMGXB4Q9UGU5 601 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 RWDD2AQ9UIY3 292 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMCO1Q9UM00 188 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCL26Q9Y258 94 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMED5Q9Y3A6 229 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 U3KQK5 164 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 CACNA1EQ15878 2313 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPOAP1O95153 1857 aa-0.46□□□□□ -2.48
RNU6-170P-201ENST00000362832 PALLDQ8WX93 1383 aa-0.46□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms