RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360779.3

SDCBP2-202, Transcript of syndecan binding protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SDCBP2, Length 1,519 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2-202ENST00000360779 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 TMEM38BQ9NVV0 291 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 TINAGQ9UJW2 476 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 PROCRQ9UNN8 238 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.64□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 LAMA5O15230 3695 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 PSKH1P11801 424 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ALOX5APP20292 161 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CAPZA2P47755 286 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CDONQ4KMG0 1287 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 TEX30Q5JUR7 227 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 VWA1Q6PCB0 445 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 LRRN1Q6UXK5 716 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ATCAYQ86WG3 371 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 DOLPP1Q86YN1 238 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 OR52N5Q8NH56 324 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ABHD6Q9BV23 337 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 MROQ9BYG7 248 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 C1orf198Q9H425 327 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 BABAM2Q9NXR7 383 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ASH2LQ9UBL3 628 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 DNAJC13O75165 2243 aa14.63□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 METTL15A6NJ78 407 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 H2BFMP0C1H6 154 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CD36P16671 472 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 EGR3Q06889 387 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 FOXF2Q12947 444 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 KCNMB1Q16558 191 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 SYS1Q8N2H4 156 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 WBP1Q96G27 269 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 OPALINQ96PE5 141 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF649Q9BS31 505 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 SIAEQ9HAT2 523 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.62□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 H3BSA7 217 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CCRL2O00421 344 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 PSMB10P40306 273 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 TAS2R43P59537 309 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 NABP1Q96AH0 204 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 SLAMF6Q96DU3 332 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 OR8B4Q96RC9 309 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 AMELYQ99218 206 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 RNF121Q9H920 327 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ELOVL3Q9HB03 270 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 A0A096LPE4 126 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 A0A1W2PPZ6 126 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CRHP06850 196 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 GLI4P10075 376 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 HSD11B1P28845 292 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 TIMP3P35625 211 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 LIPAP38571 399 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 PMPCAQ10713 525 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 AQP6Q13520 282 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 STK11Q15831 433 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 OR7E24Q6IFN5 339 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 PCSK4Q6UW60 755 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 SEM1Q6ZVN7 128 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ISYNA1Q9NPH2 558 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.61□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CIB4A0PJX0 185 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 SULT1C4O75897 302 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CST2P09228 141 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 CELP19835 753 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 MPGP29372 298 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 RGS6P49758 472 aa14.6□□□□□ -0.07
SDCBP2-202ENST00000360779 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms