RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF254O75437 659 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 PTTG1O95997 202 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 QDPRP09417 244 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 GDF1P27539 372 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CCR9P51686 369 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 HIST3H3Q16695 136 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CREB3L2Q70SY1 520 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 HDDC2Q7Z4H3 204 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CATSPERDQ86XM0 798 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 GJE1A6NN92 205 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 PDCD5O14737 125 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF432O94892 652 aa15.9■□□□□ 0.14
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ACTB-201ENST00000331789 CASRP41180 1078 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 IL17RDQ8NFM7 739 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 GPR148Q8TDV2 347 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 SFXN2Q96NB2 322 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CYSLTR2Q9NS75 346 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 CENPMQ9NSP4 180 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-201ENST00000331789 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.89■□□□□ 0.13
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ACTB-201ENST00000331789 NPR2P20594 1047 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 RFC3P40938 356 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR1C1Q15619 314 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 HES5Q5TA89 166 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 STAC2Q6ZMT1 411 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 GGNQ86UU5 652 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 UBQLNLQ8IYU4 475 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR9K2Q8NGE7 335 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 IP6K3Q96PC2 410 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 TCF7L1Q9HCS4 588 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 BRD7Q9NPI1 651 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ABI3Q9P2A4 366 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.89■□□□□ 0.13
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ACTB-201ENST00000331789 NPIPA2E9PIF3 369 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 NPIPA3F8WFD2 350 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 33.5
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ACTB-201ENST00000331789 PHYHD1Q5SRE7 291 aa15.88■□□□□ 0.13
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ACTB-201ENST00000331789 Q8N402 240 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR2M7Q8NG81 312 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR2B2Q9GZK3 357 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 R4GMQ9 66 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 A0A0G2JMP0 313 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 A0A0X1KG70 313 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CDRT15L2A8MXV6 281 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 VAMP5O95183 116 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 H2BFMP0C1H6 154 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 ADRA2CP18825 462 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CARD18P57730 90 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SCN1BQ07699 218 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
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ACTB-201ENST00000331789 SULF2Q8IWU5 870 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR4M2Q8NGB6 313 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR10S1Q8NGN2 331 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 RNF133Q8WVZ7 376 aa15.88■□□□□ 0.13
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ACTB-201ENST00000331789 TMEM106AQ96A25 262 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 SLAMF6Q96DU3 332 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 OR2M2Q96R28 347 aa15.88■□□□□ 0.13
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ACTB-201ENST00000331789 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 LHFPL6Q9Y693 200 aa15.88■□□□□ 0.13
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ACTB-201ENST00000331789 PTPRBP23467 1997 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 APOA1P02647 267 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 RAC3P60763 192 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 POU4F3Q15319 338 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-201ENST00000331789 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
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