RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 ETFDHQ16134 617 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC58Q4VC31 144 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 DEGS2Q6QHC5 323 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 DPY19L4Q7Z388 723 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 FGD2Q7Z6J4 655 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 FAM57AQ8TBR7 257 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 THEM6Q8WUY1 208 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 OR5M11Q96RB7 305 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF649Q9BS31 505 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 UPB1Q9UBR1 384 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 GTF3C1Q12789 2109 aa15.92■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF254O75437 659 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 RGS6P49758 472 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 OR5M9Q8NGP3 310 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 GATAD2BQ8WXI9 593 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 C11orf40Q8WZ69 217 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 TMIGD2Q96BF3 282 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 MROQ9BYG7 248 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 KCNN2Q9H2S1 579 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 POLE4Q9NR33 117 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 UNC79Q9P2D8 2635 aa15.91■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 WIPF3A6NGB9 483 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 METTL15A6NJ78 407 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF587BE7ETH6 402 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 J3QLW9 94 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 FARS2O95363 451 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 TGM6O95932 706 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 TPOP07202 933 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ADRA2AP08913 450 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 CD36P16671 472 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 CPEP16870 476 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF19P17023 458 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 AGTR1P30556 359 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ROM1Q03395 351 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 TPBGQ13641 420 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 TRAM1Q15629 374 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 OR2G6Q5TZ20 316 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 FAM214BQ7L5A3 538 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF485Q8NCK3 441 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 C4orf36Q96KX1 117 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 C1orf198Q9H425 327 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 SIAEQ9HAT2 523 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 CRLF2Q9HC73 371 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 NOTCH2Q04721 2471 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.9■□□□□ 0.14
SYNE4-201ENST00000324444 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 LRRTM2O43300 516 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 PCBD1P61457 104 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 SGCAQ16586 387 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 C4orf17Q53FE4 359 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 C1orf185Q5T7R7 199 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 FAM27BQ5VT28 67 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GPR107Q5VW38 600 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GFRALQ6UXV0 394 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 KRT77Q7Z794 578 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 WDFY1Q8IWB7 410 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF679Q8IYX0 411 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 OR6K3Q8NGY3 331 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 OR52N5Q8NH56 324 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 YIPF6Q96EC8 236 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 OPALINQ96PE5 141 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 COQ7Q99807 217 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 NIPAL2Q9H841 368 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 GPR35Q9HC97 309 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 IKZF2Q9UKS7 526 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.89■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 H3BSA7 217 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 UPK3AO75631 287 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 CD1AP06126 327 aa15.88■□□□□ 0.13
SYNE4-201ENST00000324444 OR3A2P47893 321 aa15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms