RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 EGFL6Q8IUX8 553 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 HTRA1Q92743 480 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 NABP1Q96AH0 204 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 YIPF6Q96EC8 236 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD6Q9BV23 337 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM38BQ9NVV0 291 aa18.27■□□□□ 0.52
PACSIN3-201ENST00000298838 PSMD9O00233 223 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SULT1C4O75897 302 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 LALBAP00709 142 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TACSTD2P09758 323 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TGFBR2P37173 567 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PER3P56645 1201 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TAS2R43P59537 309 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RTL6Q6ICC9 239 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 DCXRQ7Z4W1 244 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 UBE2J2Q8N2K1 259 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 OR52N5Q8NH56 324 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 UFD1Q92890 307 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 AMELYQ99218 206 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXB1Q99853 325 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ACOXLQ9NUZ1 547 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM215AQ9Y5M1 114 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 LHFPL6Q9Y693 200 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 CACNA1CQ13936 2221 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 NOL3O60936 208 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 CPEP16870 476 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 OR3A2P47893 321 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SIRPAP78324 504 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SSX1Q16384 188 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 LIPKQ5VXJ0 399 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 CORO6Q6QEF8 472 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ST7LQ8TDW4 575 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PELI1Q96FA3 418 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 OR8B4Q96RC9 309 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 MROQ9BYG7 248 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SIAEQ9HAT2 523 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ASH2LQ9UBL3 628 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 MALT1Q9UDY8 824 aa18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ATRXP46100 2492 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 METTL15A6NJ78 407 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC19A2O60779 497 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 OR8G3PP0DMU2 310 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 EDN3P14138 238 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ROM1Q03395 351 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RBPJQ06330 500 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TPBGQ13641 420 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PHC2Q8IXK0 858 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 YIPF7Q8N8F6 280 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ISOC1Q96CN7 298 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF416Q9BWM5 594 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 C1orf198Q9H425 327 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 NDUFB11Q9NX14 153 aa18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 TMBIM6P55061 237 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 NRN1LQ496H8 165 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM27BQ5VT28 67 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXW9Q5XUX1 488 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SEM1Q6ZVN7 128 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT77Q7Z794 578 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF679Q8IYX0 411 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFP41Q8N8Y5 198 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 OR6K3Q8NGY3 331 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RAB2BQ8WUD1 216 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 PRSS50Q9UI38 385 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ENPP5Q9UJA9 477 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZGRF1Q86YA3 2104 aa18.24■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPB2A8KAH6 182 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 B4GALT1P15291 398 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 CELP19835 753 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 FAPQ12884 760 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPB2Q16082 182 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRN1Q6UXK5 716 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC18Q8N456 261 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP6Q96JE9 813 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFP3Q96NJ6 502 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF835Q9Y2P0 537 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 E9PI62 339 aa18.23■□□□□ 0.51
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms