RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265175.5

SEC24B-201, Transcript of SEC24 homolog B, COPII coat complex component, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SEC24B, Length 5,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24B-201ENST00000265175 HTR5AP47898 357 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 CSNK1G2P78368 415 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 TIMM29Q9BSF4 260 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 ST3GAL2Q16842 350 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 ARSGQ96EG1 525 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SCMH1Q96GD3 660 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 HS3ST2Q9Y278 367 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 V9GYS6 101 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 MEIKINA0A087WXM9 373 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 LRP5LA4QPB2 252 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SEMA4FO95754 770 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 PTGER4P35408 488 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 BIDP55957 195 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 GPNMBQ14956 572 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SMIM7Q9BQ49 75 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 DLL4Q9NR61 685 aa11.64□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 RNF212BA8MTL3 300 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SCGB2A1O75556 95 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 IL5P05113 134 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 AVPR2P30518 371 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 APLNRP35414 380 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 MLF1P58340 268 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 UQCC3Q6UW78 93 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SLC25A19Q9HC21 320 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 PADI1Q9ULC6 663 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 YKT6O15498 198 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 FGF7P21781 194 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SDHBP21912 280 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 DUSP1P28562 367 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 THBS3P49746 956 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 P2RX1P51575 399 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 ZNF684Q5T5D7 378 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 KIAA0895LQ68EN5 471 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 OR51H1Q8NH63 302 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SDF2Q99470 211 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 CHST11Q9NPF2 352 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 LRP3O75074 770 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 CTSLP07711 333 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 CSF2RAP15509 400 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 FAM209AQ5JX71 171 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 STAC2Q6ZMT1 411 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 STT3BQ8TCJ2 826 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SPACA5Q96QH8 159 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 HIPK2Q9H2X6 1198 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 PRO1933Q9H354 126 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 ABCA1O95477 2261 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 DSCR3O14972 297 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 PRAMEF4O60810 478 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 FABP4P15090 132 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 LTC4SQ16873 150 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SSX7Q7RTT5 188 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 OR2W3Q7Z3T1 314 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.63□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 BLACEA4D250 179 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 AQP8O94778 261 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 PTHLHP12272 177 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 IRF2P14316 349 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 BAMBIQ13145 260 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 MED25Q71SY5 747 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 LRFN5Q96NI6 719 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 TMED7Q9Y3B3 224 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 A0A0G2JNG1 304 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 KLK8O60259 260 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 ADRA2CP18825 462 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 DCAF7P61962 342 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 PJVKQ0ZLH3 352 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 KIR2DS5Q14953 304 aa11.62□□□□□ -0.55
SEC24B-201ENST00000265175 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms