RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 RACGAP1Q9H0H5 632 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 KCNN2Q9H2S1 579 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 BAIAP2Q9UQB8 552 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FKBP7Q9Y680 259 aa19.25■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 LOC100509620A0A075B734 347 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 RENP00797 406 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 TFP02787 698 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 OSMP13725 252 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 APEX1P27695 318 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CDKN1AP38936 164 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 KRT80Q6KB66 452 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FBXL14Q8N1E6 418 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 IQCF1Q8N6M8 205 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 POM121L2Q96KW2 1035 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CXorf56Q9H5V9 222 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ZNF442Q9H7R0 627 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FAIMQ9NVQ4 179 aa19.24■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 TMEM129A0AVI4 362 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FAM171A2A8MVW0 826 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 GPRIN2O60269 458 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 LSM6P62312 80 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ADAM8P78325 824 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CDK5Q00535 292 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 DAG1Q14118 895 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 MEP1BQ16820 701 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 VHLLQ6RSH7 139 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SLC26A10Q8NG04 563 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 PERPQ96FX8 193 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 WACQ9BTA9 647 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 BDH2Q9BUT1 245 aa19.23■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 NDUFS7O75251 213 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SNAP29O95721 258 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 OR4A8P0C604 315 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ARHGDIAP52565 204 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 PCBD1P61457 104 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 HSF2Q03933 536 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CRMP1Q14194 572 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ZNF774Q6NX45 483 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 DNM1P34Q6PK57 102 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ATG16L2Q8NAA4 619 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 TEX47Q8TBZ9 253 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 C1orf198Q9H425 327 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 CMC2Q9NRP2 79 aa19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 C12orf71A8MTZ7 269 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 H3BN98 237 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 PTHP01270 115 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 FCGR1AP12314 374 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 STOMP27105 288 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 GRK5P34947 590 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SERPINF1P36955 418 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H3AP68431 136 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 PLP2Q04941 152 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 GINS1Q14691 196 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 EFNB3Q15768 340 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 HIST2H3AQ71DI3 136 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 HIPK1Q86Z02 1210 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 WFDC11Q8NEX6 87 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 ZNF556Q9HAH1 456 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 KLHL21Q9UJP4 597 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 LHFPL6Q9Y693 200 aa19.21■□□□□ 0.67
SYF2-201ENST00000236273 F8P00451 2351 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 G3V2T6 193 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 MITFO75030 526 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 POU1F1P28069 291 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PYCR1P32322 319 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 GLRXP35754 106 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 WNT5AP41221 380 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 KDM4DQ6B0I6 523 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PTP4A1Q93096 173 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PKP2Q99959 881 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 HCAR1Q9BXC0 346 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CACNG6Q9BXT2 260 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PLK3Q9H4B4 646 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 ASH2LQ9UBL3 628 aa19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP19.2■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CLUP10909 449 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 PCSK6P29122 969 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 APLNRP35414 380 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 GGT2P36268 569 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 CENPAP49450 140 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A1P53007 311 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 TEKQ02763 1124 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 GLO1Q04760 184 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 AQP6Q13520 282 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D28Q2M2D7 210 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 TMEM236Q5W0B7 351 aa19.19■□□□□ 0.66
SYF2-201ENST00000236273 SLC27A4Q6P1M0 643 aa19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms