RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627212.2

RAPGEF6-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,694 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-215ENST00000627212 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 NME2P1O60361 137 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CPT2P23786 658 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 GABRA2P47869 451 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 FOXK1P85037 733 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 DEFA6Q01524 100 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 GUCA2AQ02747 115 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TPBGQ13641 420 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 EID2Q8N6I1 236 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR51H1Q8NH63 302 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SFT2D1Q8WV19 159 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SGPP1Q9BX95 441 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 MCOLN1Q9GZU1 580 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 FZD6O60353 706 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CCR2P41597 374 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 AKR1C3P42330 323 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 RFX2P48378 723 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SSTP61278 116 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 PARM1Q6UWI2 310 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 AMER3Q8N944 861 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR51E1Q8TCB6 317 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CPT1CQ8TCG5 803 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 NRTNQ99748 197 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CSAG2Q9Y5P2 127 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.12□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 IFITM5A6NNB3 132 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 A8MVM7 634 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CLDN1O95832 211 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ABHD16AO95870 558 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TGM1P22735 817 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM201Q5SNT2 666 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SIRT6Q8N6T7 355 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ANKRD53Q8N9V6 530 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CALHM2Q9HA72 323 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 BLACEA4D250 179 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 MCRIP1C9JLW8 97 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TSTD3H0UI37 97 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CTSLP07711 333 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CD1CP29017 333 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 GCH1P30793 250 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TNFRSF4P43489 277 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 MAP2K6P52564 334 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 RAB31Q13636 194 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 GPR119Q8TDV5 335 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TSLPQ969D9 159 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 YIPF5Q969M3 257 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 LYSMD1Q96S90 227 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 RPH3ALQ9UNE2 315 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SCN1AP35498 2009 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 IMPA2O14732 288 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 IRF2P14316 349 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR1D5P58170 312 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 C17orf67Q0P5P2 114 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 CDC20Q12834 499 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 FAM26DQ5JW98 314 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR4N2Q8NGD1 307 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLC46A1Q96NT5 459 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR2A14Q96R47 310 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 KCNJ15Q99712 375 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 FANCFQ9NPI8 374 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ETV7Q9Y603 341 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 OR5H14A6NHG9 310 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 ARGFXA6NJG6 315 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 MPPED1O15442 326 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 GPR137BO60478 399 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SCGB1D1O95968 90 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRR35P0CG20 571 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TM4SF4P48230 202 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 DIO1P49895 249 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 DCAF7P61962 342 aa9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
RAPGEF6-215ENST00000627212 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms