RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 ADCK1Q86TW2 530 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SLC30A7Q8NEW0 376 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 OR4C15Q8NGM1 316 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TNFRSF11BO00300 401 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 CST2P09228 141 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PLP2Q04941 152 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TSPAN31Q12999 210 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TNK1Q13470 666 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PGBD2Q6P3X8 592 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 BTBD10Q9BSF8 475 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 OR52D1Q9H346 318 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 ABCA1O95477 2261 aa21.48■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 AQP12BA6NM10 295 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SNAP29O95721 258 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 RAP2AP10114 183 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 ZNF32P17041 273 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 NUDT6P53370 316 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 AQP12AQ8IXF9 295 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 CMAHPQ9Y471 501 aa21.47■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SOCS2O14508 198 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 IMPA2O14732 288 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 ARPC3O15145 178 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SSX4O60224 188 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 CTLA4P16410 223 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 MSR1P21757 451 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 LAP3P28838 519 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SLC6A6P31641 620 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PPOXP50336 477 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 EFNA4P52798 201 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 RPS23P62266 143 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TBC1D28Q2M2D7 210 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 OR2T5Q6IEZ7 315 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 OR1J2Q8NGS2 313 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 OR2T29Q8NH02 315 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 DOK1Q99704 481 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 POLE4Q9NR33 117 aa21.46■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 A0A1W2PPL8 197 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TMEM129A0AVI4 362 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 FAM171A2A8MVW0 826 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 GPRIN2O60269 458 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 EVX1P49640 407 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 HSF2Q03933 536 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 ZNF620Q6ZNG0 422 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PTCHD4Q6ZW05 846 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SYT9Q86SS6 491 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 WACQ9BTA9 647 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SYT4Q9H2B2 425 aa21.45■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PPP1R3DO95685 299 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 DSCR9P59020 149 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 PCBD1P61457 104 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 ADGRG5Q8IZF4 528 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SVOPLQ8N434 492 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 OR9Q2Q8NGE9 314 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SNX18Q96RF0 628 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 REEP1Q9H902 201 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CDH20Q9HBT6 801 aa21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CCNB2O95067 398 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 F12P00748 615 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 APEX1P27695 318 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 PCSK6P29122 969 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 PSG4Q00888 419 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 GK3PQ14409 553 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 MSMPQ1L6U9 139 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 OR10H5Q8NGA6 315 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SAMD8Q96LT4 415 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SORCS2Q96PQ0 1159 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SMR3AQ99954 134 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 ZNF416Q9BWM5 594 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 OR2H1Q9GZK4 316 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 RASSF4Q9H2L5 321 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa21.44■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 HIVEP2P31629 2446 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 C12orf71A8MTZ7 269 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 IDH3BO43837 385 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SLC16A7O60669 478 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 SCG5P05408 212 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 CCL2P13500 99 aa21.43■■□□□ 1.02
PMS1-220ENST00000618056 APLNRP35414 380 aa21.43■■□□□ 1.02
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