RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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RABGEF1-209ENST00000607882 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.19□□□□□ -0.62
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RABGEF1-209ENST00000607882 NPIPB9F8W1W9 429 aa11.17□□□□□ -0.62
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RABGEF1-209ENST00000607882 PRKCAP17252 672 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 CAPZA2P47755 286 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGEF1-209ENST00000607882 QPRTQ15274 297 aa11.17□□□□□ -0.62
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