RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598362.1

GRAMD1A-208, Transcript of GRAM domain containing 1A, human

TSL 2

Gene GRAMD1A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CIB1	Q99828	191 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NGB	Q9NPG2	151 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		6.56	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ATR	Q13535	2644 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGHV1-18	A0A0C4DH31	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362		A0A1W2PPR1	153 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR6C68	A6NDL8	312 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ATE1	O95260	518 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RAB36	O95755	333 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	BAG2	O95816	211 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGKV3-15	P01624	115 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CD3E	P07766	207 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CELA3B	P08861	270 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CD79A	P11912	226 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MSR1	P21757	451 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CRABP1	P29762	137 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ALDH3A2	P51648	485 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CRISP1	P54107	249 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ESRRG	P62508	458 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	BSPH1	Q075Z2	132 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NPRL3	Q12980	569 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DAG1	Q14118	895 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CRMP1	Q14194	572 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GINS1	Q14691	196 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ETFDH	Q16134	617 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GSG1	Q2KHT4	349 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SKA3	Q8IX90	412 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CBR4	Q8N4T8	237 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	TSSK2	Q96PF2	358 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SH3GL3	Q99963	347 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	NUAK2	Q9H093	628 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RERGL	Q9H628	205 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SIAE	Q9HAT2	523 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MOV10	Q9HCE1	1003 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	EMC7	Q9NPA0	242 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	POLE4	Q9NR33	117 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CMC2	Q9NRP2	79 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	USE1	Q9NZ43	259 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	HIVEP2	P31629	2446 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DPRX	A6NFQ7	191 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ZAR1L	A6NP61	321 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	RNF212B	A8MTL3	300 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	DCTN6	O00399	190 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ABCD4	O14678	606 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SURF4	O15260	269 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GPANK1	O95872	356 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	IGLV1-44	P01699	117 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ALPL	P05186	524 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	SCG5	P05408	212 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CST2	P09228	141 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CECR9	P0C854	216 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PATE4	P0C8F1	98 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ANPEP	P15144	967 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CBR1	P16152	277 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PAX7	P23759	505 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PTAFR	P25105	342 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	CD40	P25942	277 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PEX2	P28328	305 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	LAP3	P28838	519 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	PYCR1	P32322	319 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	ARR3	P36575	388 aa		6.54	□□□□□ -1.36
GRAMD1A-208	ENST00000598362	GIPR	P48546	466 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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