RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 NABP1Q96AH0 204 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 TAMM41Q96BW9 452 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 C5orf49A4QMS7 147 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BSA7 217 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ICMTO60725 284 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR7A10O76100 309 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 IGF2P01344 180 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MT-ND1P03886 318 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPAN19P0C672 248 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PCGF2P35227 344 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 AQP2P41181 271 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 GDI2P50395 445 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ERVK-25P63136 954 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PSG4Q00888 419 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRNQ5BIV9 151 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ARMC4Q5T2S8 1044 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DOK3Q7L591 496 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC30A8Q8IWU4 369 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DPP10Q8N608 796 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PFN4Q8NHR9 129 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC58Q96CX6 371 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CGREF1Q99674 301 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SMURF2Q9HAU4 748 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MMP26Q9NRE1 261 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 INIPQ9NRY2 104 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CYSLTR2Q9NS75 346 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NPTNQ9Y639 398 aa8.71□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NGFP01138 241 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV2-70P01814 119 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CD55P08174 381 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NR2C1P13056 603 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 FUT1P19526 365 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PRTN3P24158 256 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM34P42696 430 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CRYBA2P53672 197 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1CBP62140 327 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 FMODQ06828 376 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CD47Q08722 323 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SGCAQ16586 387 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZMAT1Q5H9K5 638 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM27BQ5VT28 67 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ABHD4Q8TB40 342 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC8CQ8TDW0 803 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC26A7Q8TE54 656 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 LIPHQ8WWY8 451 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NSMAFQ92636 917 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 SGTBQ96EQ0 304 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DUX5Q96PT3 197 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DIRC2Q96SL1 478 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 RABEP2Q9H5N1 569 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NANOGQ9H9S0 305 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 MSL2Q9HCI7 577 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NPHS2Q9NP85 383 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 C20orf141Q9NUB4 165 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 DCAF16Q9NXF7 216 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF69Q9UC07 566 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NUP50Q9UKX7 468 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFAF1Q9Y375 327 aa8.7□□□□□ -1.02
EFTUD2-226ENST00000593200 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms