RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 ZP4Q12836 540 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 GSG1Q2KHT4 349 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 VWA2Q5GFL6 755 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 OR8K3Q8NH51 312 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 OR52N5Q8NH56 324 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 RNF128Q8TEB7 428 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 HSD17B8Q92506 261 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 HGDQ93099 445 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM106AQ96A25 262 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 NXPE2Q96DL1 559 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 GFI1Q99684 422 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXQ1Q9C009 403 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 NRSN2Q9GZP1 204 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 HRASLSQ9HDD0 168 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 ALKBH4Q9NXW9 302 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 TAS2R5Q9NYW4 299 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 CTSFQ9UBX1 484 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 SUSD2Q9UGT4 822 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 RARRES3Q9UL19 164 aa8.28□□□□□ -1.08
EFTUD2-222ENST00000592408 SCN2AQ99250 2005 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2QL1A1L167 161 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 MEGF11A6BM72 1044 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 IDSB3KWA1 339 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 XRCC3O43542 346 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 GMFGO60234 142 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ALOX12BO75342 701 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 AQP8O94778 261 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 GLSO94925 669 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 PLGP00747 810 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 SULT1A3P0DMM9 295 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 SULT1A4P0DMN0 295 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 BCKDHBP21953 392 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ACHEP22303 614 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK2P24941 298 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 CXCL12P48061 93 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 PTH2RP49190 550 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 CCR6P51684 374 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 GNG2P59768 71 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTBP60709 375 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR85P60893 370 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTG1P63261 375 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 PUDPQ08623 228 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 MEP1BQ16820 701 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR38Q5JTN6 314 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 UTS2BQ765I0 119 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 COX15Q7KZN9 410 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD37Q7Z713 158 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRG3Q86Y34 549 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 IZUMO1Q8IYV9 350 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 OR52I2Q8NH67 350 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC22A8Q8TCC7 542 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 MCHR2Q969V1 340 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 MED30Q96HR3 178 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 RADILQ96JH8 1075 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 PISDQ9UG56 409 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXL3Q9UKT7 428 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 R4GMQ9 66 aa8.27□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0A6YYH2 397 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PNV4 684 aa8.26□□□□□ -1.09
EFTUD2-222ENST00000592408 A6NJ64 397 aa8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms