RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FRYQ5TBA9 3013 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.5□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C17orf51A8MQB3 221 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LRRN3E7EW58 273 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PTGES3LE9PB15 166 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 E9PLN8 166 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 J3KRW8 73 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC16A7O60669 478 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ENTPD6O75354 484 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF254O75437 659 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 PTHP01270 115 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 HLA-DQA2P01906 255 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SPI1P17947 270 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 SLC15A1P46059 708 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 FXYD6P3P58550 94 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 TAS2R43P59537 309 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 LSM6P62312 80 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC35A2P78381 396 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ST3GAL4Q11206 333 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 APOFQ13790 326 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CRMP1Q14194 572 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 P2RY6Q15077 328 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 KCNMB1Q16558 191 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 HIST3H3Q16695 136 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 NADK2Q4G0N4 442 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C10orf128Q5T292 105 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf185Q5T7R7 199 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR7E24Q6IFN5 339 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.49□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.49□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CACNA1CQ13936 2221 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CHD6Q8TD26 2715 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 DAPL1A0PJW8 107 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OR6C68A6NDL8 312 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF716A6NP11 495 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 MYL12BO14950 172 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 DHHO43323 396 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SLC19A2O60779 497 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 SERPINI2O75830 405 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF432O94892 652 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CLIC3O95833 236 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 PF4P02776 101 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 OPN1LWP04000 364 aa6.48□□□□□ -1.37
SMAD4-210ENST00000590061 CDK1P06493 297 aa6.48□□□□□ -1.37
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