RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 GSTT1P30711 240 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 CDAP32320 146 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 SLC15A1P46059 708 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 MTNR1AP48039 350 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 TFF3Q07654 80 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 POU4F2Q12837 409 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 CDSNQ15517 529 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 KLHL12Q53G59 568 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 C6orf141Q5SZD1 244 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 ZNF813Q6ZN06 617 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 DPPA2Q7Z7J5 298 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 SYT9Q86SS6 491 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 P2RY8Q86VZ1 359 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 TIGD4Q8IY51 512 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 SLC22A24Q8N4F4 322 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 C11orf40Q8WZ69 217 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 LRRC46Q96FV0 321 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 SEC61A2Q9H9S3 476 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 GALNT8Q9NY28 637 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 UBAP1Q9NZ09 502 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 LRRK2Q5S007 2527 aa10.09□□□□□ -0.79
GGA3-211ENST00000582232 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CIB4A0PJX0 185 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FAM171A2A8MVW0 826 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 LYZL6O75951 148 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FARS2O95363 451 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CST2P09228 141 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CCDC159P0C7I6 412 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 DBTP11182 482 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 B4GALT1P15291 398 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PAX7P23759 505 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 UGT2B10P36537 528 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 RPS7P62081 194 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SORDQ00796 357 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZNF91Q05481 1191 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FAM27E3Q08E93 113 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SGCAQ16586 387 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 TBRG1Q3YBR2 411 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 C9orf135Q5VTT2 229 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 KRT80Q6KB66 452 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SSX8Q7RTT4 187 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZNF511Q8NB15 262 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 OR6K6Q8NGW6 343 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 MNTQ99583 582 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ADGRL4Q9HBW9 690 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 OBP2BQ9NPH6 170 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SLC17A5Q9NRA2 495 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 IRGMA1A4Y4 181 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 TVP23AA6NH52 213 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 OR5H1A6NKK0 313 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FAM90A27PA6NNH2 459 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 C12orf71A8MTZ7 269 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 C16orf97H3BN30 126 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 J3QRE1 110 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 TMCC2O75069 709 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 RAD51DO75771 328 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 MPZL1O95297 269 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 GPANK1O95872 356 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 HLA-DQA2P01906 255 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SBK2P0C263 348 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PIPP12273 146 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 PPP3CBP16298 524 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZNF823P16415 610 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 IL32P24001 234 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ENTPD1P49961 510 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 NUDT6P53370 316 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 HIST1H3AP68431 136 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 RAB40BQ12829 278 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 KLHL22Q53GT1 634 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 TIMM23BQ5SRD1 257 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 KLHL24Q6TFL4 600 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 UGT2A3Q6UWM9 527 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 B3GLCTQ6Y288 498 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 HIST2H3AQ71DI3 136 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SHFQ7M4L6 423 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SLC16A9Q7RTY1 509 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 SKA3Q8IX90 412 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 OR10H5Q8NGA6 315 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 RNFT2Q96EX2 444 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 FOXN4Q96NZ1 517 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 INTS14Q96SY0 518 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 ZNF416Q9BWM5 594 aa10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
GGA3-211ENST00000582232 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms