RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575909.1

TOM1L1-222, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 3

Gene TOM1L1, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-222	ENST00000575909	GRIA1	P42261	906 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GABRA4	P48169	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CDK16	Q00536	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	IRF8	Q02556	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	BST1	Q10588	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PEX6	Q13608	980 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC10A1	Q14973	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC15A2	Q16348	729 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ARC	Q7LC44	396 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ACOT1	Q86TX2	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	STX19	Q8N4C7	294 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PQLC3	Q8N755	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CERS2	Q96G23	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SMIM10	Q96HG1	83 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ASB7	Q9H672	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	VNN3	Q9NY84	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	IFNK	Q9P0W0	207 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NPIPA1	Q9UND3	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CLUH	O75153	1309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1B0GTI1	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909		A0A1B0GV72	72 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	EFCAB7	A8K855	629 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SERPINE3	A8MV23	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC17A2	O00624	439 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FADS1	O60427	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FCMR	O60667	390 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GJB5	O95377	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FBP1	P09467	338 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ADRB3	P13945	408 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	LAP3	P28838	519 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	HLCS	P50747	726 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCL7	P80098	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	STX4	Q12846	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF154	Q13106	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	DPYSL3	Q14195	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	KCNJ8	Q15842	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-222	ENST00000575909	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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