RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1B0GUH1	482 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TVP23A	A6NH52	213 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	FAM166B	A8MTA8	275 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395		H0YC42	278 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395		J3QLW9	94 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	LRRTM2	O43300	516 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	SLC16A7	O60669	478 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	GPX5	O75715	221 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CEACAM4	O75871	244 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	VAMP5	O95183	116 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	GPANK1	O95872	356 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	IGHG1	P01857	330 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PGA4	P0DJD7	388 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PGA3	P0DJD8	388 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF19	P17023	458 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CRABP1	P29762	137 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	GABRA5	P31644	462 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PTGS2	P35354	604 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TGFBR1	P36897	503 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TNFSF10	P50591	281 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	AGFG1	P52594	562 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	BLVRA	P53004	296 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	HCCS	P53701	268 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CASP6	P55212	293 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	OR12D2	P58182	307 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TAS2R43	P59537	309 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	RAC3	P60763	192 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PLGLB1	Q02325	96 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	GPR50	Q13585	617 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	HBM	Q6B0K9	141 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	VASN	Q6EMK4	673 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM225	Q6GV28	225 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	USP43	Q70EL4	1123 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	GPAT4	Q86UL3	456 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	SYT14	Q8NB59	555 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	OR6X1	Q8NH79	312 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	C4orf36	Q96KX1	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	MNT	Q99583	582 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CENPO	Q9BU64	300 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	EMC6	Q9BV81	110 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	RERGL	Q9H628	205 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	WDR76	Q9H967	626 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	MRPL22	Q9NWU5	206 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	RTTN	Q86VV8	2226 aa		6.68	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	SLC35F4	A4IF30	521 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PRR32	B1ATL7	298 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CENPBD1	B2RD01	187 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395		E9PI62	339 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PHYH	O14832	338 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CELA3A	P09093	270 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	GAA	P10253	952 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PSKH1	P11801	424 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF43	P17038	809 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CD53	P19397	219 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CEL	P19835	753 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	ENPP1	P22413	925 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	MAGEA5	P43359	124 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	SERPINB10	P48595	397 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	LHX2	P50458	406 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CLDN15	P56746	228 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CARD18	P57730	90 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CLRN1	P58418	232 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	TUBA1B	P68363	451 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	GLO1	Q04760	184 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	FMOD	Q06828	376 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	CAMK2D	Q13557	499 aa		6.67	□□□□□ -1.34
TPM1-231	ENST00000561395	SLC17A1	Q14916	467 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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