RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557295.1

LINC00640-204, long intergenic non-protein coding RNA 640, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00640, Length 708 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00640-204ENST00000557295 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 CDC26Q8NHZ8 85 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 NFKBIDQ8NI38 313 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 METTL6Q8TCB7 284 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 RAB40AQ8WXH6 277 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 CDS1Q92903 461 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ZG16BQ96DA0 208 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 LAT2Q9GZY6 243 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF385DQ9H6B1 395 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 BEX1Q9HBH7 125 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM181Q9P2C4 612 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TENM3Q9P273 2699 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF587BE7ETH6 402 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 RHODO00212 210 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 NR5A2O00482 541 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TBX19O60806 448 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 SHBGP04278 402 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 LCKP06239 509 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 POU1F1P28069 291 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ARR3P36575 388 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ALDH3B1P43353 468 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 MTNR1AP48039 350 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 SERPINB8P50452 374 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ATP4BP51164 291 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 OR2B6P58173 313 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 UFM1P61960 85 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TUBA1BP68363 451 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 SLC35A1P78382 337 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 DCST2Q5T1A1 773 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 CDC73Q6P1J9 531 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 C16orf87Q6PH81 154 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 PAQR6Q6TCH4 344 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TUBA1AQ71U36 451 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 AAED1Q7RTV5 226 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 SZRD1Q7Z422 152 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 GRINAQ7Z429 371 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TMEM217Q8N7C4 229 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 DEFB108BQ8NET1 73 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 OR9K2Q8NGE7 335 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 OR4F5Q8NH21 305 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 OR11A1Q9GZK7 315 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 NMUR2Q9GZQ4 415 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 NOX3Q9HBY0 568 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 CTPS2Q9NRF8 586 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 NINJ2Q9NZG7 142 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 STK38LQ9Y2H1 464 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 A8MT66 165 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF208O43345 1280 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TIPRLO75663 272 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 KRT33AO76009 404 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 NDUFA7O95182 113 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 SPARCP09486 303 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 OMGP23515 440 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 HMOX2P30519 316 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 GLRXP35754 106 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ARL3P36405 182 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 MAGEA4P43358 317 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 MAGEA12P43365 314 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 HMGA2P52926 109 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ARF1P84077 181 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 EFNB1P98172 346 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF91Q05481 1191 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 ZNF141Q15928 474 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 TAF9Q16594 264 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 VAX1Q5SQQ9 334 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 PDZK1Q5T2W1 519 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 KRT80Q6KB66 452 aa5.68□□□□□ -1.5
LINC00640-204ENST00000557295 NOXRED1Q6NXP6 359 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.8 ms