RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-210ENST00000555658 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 GPR119Q8TDV5 335 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 PAQR8Q8TEZ7 354 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM239Q8WW34 195 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ST8SIA1Q92185 356 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 PSMF1Q92530 271 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ARSGQ96EG1 525 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF597Q96LX8 424 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 DACH2Q96NX9 599 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 NODALQ96S42 347 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 WFDC6Q9BQY6 131 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 SLC19A3Q9BZV2 496 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 UCK2Q9BZX2 261 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 SACM1LQ9NTJ5 587 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 VNN3Q9NY84 501 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 MED11Q9P086 117 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 LRFN1Q9P244 771 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 DKK4Q9UBT3 224 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 NUP50Q9UKX7 468 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 RAB26Q9ULW5 256 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 SPATA2Q9UM82 520 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 MED31Q9Y3C7 131 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 SCN3AQ9NY46 2000 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 A0A087WUJ7 227 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 A0A087WUU8 490 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 A0A087WZY1 265 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 A0A1W2PPW3 197 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 OR5H15A6NDH6 313 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 A8MXE2 369 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 H3BN98 237 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 GPR171O14626 319 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 PTP4A3O75365 173 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 RCBTB2O95199 551 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 SNAP29O95721 258 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 TOMM40O96008 361 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 HIST1H2ABP04908 130 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 CCL3P10147 92 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 PF4V1P10720 104 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 IFI30P13284 250 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 IL11P20809 199 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 CBLP22681 906 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 CHMP24386 653 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 POU1F1P28069 291 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 UQCRC1P31930 480 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 CAPGP40121 348 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 DAPP51397 102 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 UCNP55089 124 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 TIRAPP58753 221 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 RAB4BP61018 213 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ESRRGP62508 458 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ARG2P78540 354 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 CFHR3Q02985 330 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 PRKCDQ05655 676 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 NPRL3Q12980 569 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 TSPAN31Q12999 210 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 MFAP5Q13361 173 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 IL18R1Q13478 541 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 SEC23BQ15437 767 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 OR1C1Q15619 314 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 KCNJ8Q15842 424 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 NHSL2Q5HYW2 709 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 TEX30Q5JUR7 227 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 C6orf52Q5T4I8 152 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 TIGD3Q6B0B8 471 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 SPINK14Q6IE38 97 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 KRT80Q6KB66 452 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 C1orf94Q6P1W5 598 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 GRINAQ7Z429 371 aa3.68□□□□□ -1.82
FOXN3-210ENST00000555658 MDGA2Q7Z553 956 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms