RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SVOPL	Q8N434	492 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SNX18	Q96RF0	628 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	OR52D1	Q9H346	318 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ASB6	Q9NWX5	421 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	IL20	Q9NYY1	176 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	PLCE1	Q9P212	2302 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222		G3V2T6	193 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	COX5A	P20674	150 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ERVK-25	P63136	954 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	CARD17	Q5XLA6	110 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	FAHD1	Q6P587	224 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	LINGO2	Q7L985	606 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ZNF519	Q8TB69	540 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	STMN2	Q93045	179 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ZNF566	Q969W8	418 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	MUCL1	Q96DR8	90 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SAMD8	Q96LT4	415 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	UPB1	Q9UBR1	384 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		11.94	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	CENPBD1	B2RD01	187 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	LILRA1	O75019	489 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	TXNDC12	O95881	172 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	IGHG1	P01857	330 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ITGA5	P08648	1049 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	CSF3	P09919	207 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	PGA4	P0DJD7	388 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	PGA3	P0DJD8	388 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	LYNX1	P0DP58	116 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ACADS	P16219	412 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SLC6A6	P31641	620 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	DAP	P51397	102 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	HIST3H3	Q16695	136 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	TMEM54	Q969K7	222 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	RADIL	Q96JH8	1075 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	GLTP	Q9NZD2	209 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		11.93	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222		A6NIZ1	184 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	OR5H1	A6NKK0	313 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	FAM157A	C9JC47	383 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222		H0YHG0	523 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222		M0R3G1	203 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ARPC3	O15145	178 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	KRT33A	O76009	404 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SOX14	O95416	240 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	PPP1R3D	O95685	299 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	MPG	P29372	298 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SDHA	P31040	664 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	CSNK1A1	P48729	337 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	RAP1B	P61224	184 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	RAP1A	P62834	184 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.92	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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