RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PPT2Q9UMR5 302 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 FAM159BA6NKW6 160 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LMO7DNF2Z398 122 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 H0Y980 276 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF11BO00300 401 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01565O15544 149 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 RAD51DO75771 328 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CBR3O75828 277 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SLC16A8O95907 504 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OSMP13725 252 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF20P17024 532 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 IMPA1P29218 277 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 DCTDP32321 178 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 RAB38P57729 211 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CLDN2P57739 230 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TPPP2P59282 170 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 IL11RAQ14626 422 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CMC1Q7Z7K0 106 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 BEND2Q8NDZ0 799 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SLC30A7Q8NEW0 376 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR1J1Q8NGS3 322 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR6C1Q96RD1 312 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 HRH4Q9H3N8 390 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 FGF21Q9NSA1 209 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV17A0A0B4J275 112 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 A8MVM7 634 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01387J3KSC0 135 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 HCRTO43612 131 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ANGPTL7O43827 346 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TBPP20226 339 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GDF1P27539 372 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 NBL1P41271 181 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 UQCRFS1P47985 274 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 AKR1C1Q04828 323 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ECH1Q13011 328 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SLAMF1Q13291 335 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-BQ31612 363 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TTC32Q5I0X7 151 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 NOXRED1Q6NXP6 359 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 FRMD1Q8N878 549 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 POGLUT1Q8NBL1 392 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR52E1Q8NGJ3 308 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR56B4Q8NH76 319 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OLAHQ9NV23 265 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LIPGQ9Y5X9 500 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPM1 405 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 LRP5LA4QPB2 252 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PCBD1P61457 104 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 EMX2Q04743 252 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 HIST3H3Q16695 136 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB134Q4QY38 66 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GDF7Q7Z4P5 450 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 FIZ1Q96SL8 496 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 DOK1Q99704 481 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 GALNT9Q9HCQ5 603 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MED9Q9NWA0 146 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 M0R1X1 148 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ADAP1O75689 374 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 AHSGP02765 367 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR5AC1P0C628 307 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ENGP17813 658 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 HES1Q14469 280 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 NCR3LG1Q68D85 454 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 SLC35G3Q8N808 338 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR9A4Q8NGU2 314 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD3Q8WU67 409 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 FRZBQ92765 325 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6V0BQ99437 205 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PCGF1Q9BSM1 259 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 DOHHQ9BU89 302 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 OR2J1Q9GZK6 312 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 FKRPQ9H9S5 495 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRB-210ENST00000551525 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms