RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SAXO2Q658L1 398 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GON7Q9BXV9 100 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 STUB1Q9UNE7 303 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 LIFP15018 202 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 LTBRP36941 435 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 LPCAT4Q643R3 524 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 FAM222BQ8WU58 562 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 FOXH1O75593 365 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 BTG2P78543 158 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 FOXF1Q12946 379 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CEACAM16Q2WEN9 425 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD16Q6P6B7 361 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 MIB2Q96AX9 1013 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM59Q9BXS4 323 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF69Q9UC07 566 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PR77 199 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR5B21A6NL26 309 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR2AT4A6NND4 320 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 TNFSF11O14788 317 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 P2RX6O15547 441 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CPEP16870 476 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 KCNJ3P48549 501 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ATP5J2P56134 94 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 WNT4P56705 351 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GNG3P63215 75 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ELFN2Q5R3F8 820 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF425Q6IV72 752 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR52N5Q8NH56 324 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RFT1Q96AA3 541 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SGK3Q96BR1 496 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 FUZQ9BT04 418 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A31Q9H0C2 315 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 F2RL2O00254 374 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 XPNPEP2O43895 674 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 AGTR1P30556 359 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 BSGP35613 385 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RAB7AP51149 207 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 IST1P53990 364 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 TAS2R20P59543 309 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RAB1AP62820 205 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR6F1Q8NGZ6 308 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR10D3Q8NH80 312 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 HRASLSQ9HDD0 168 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PAPLNO95428 1278 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SCGB1D2O95969 90 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PRKACAP17612 351 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CD79BP40259 229 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GPR157Q5UAW9 335 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SLC38A5Q8WUX1 472 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 RASL10BQ96S79 203 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GLTPQ9NZD2 209 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 C5orf49A4QMS7 147 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 OR7A17O14581 309 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 ARSBP15848 533 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 SDHAP31040 664 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 GZMKP49863 264 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 S100A10P60903 97 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRB-209ENST00000550857 MPPED2Q15777 294 aa7.3□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms