RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 Q9UFV3 132 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 CIB4A0PJX0 185 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 A8MXE2 369 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZNHIT1O43257 154 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 RGS10O43665 173 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 UBL3O95164 117 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 RAB36O95755 333 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 WNT11O96014 354 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PTHP01270 115 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 APOC1P02654 83 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SBK2P0C263 348 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 COX5AP20674 150 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 BMP5P22003 454 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PYCR1P32322 319 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 NTF4P34130 210 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ARR3P36575 388 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ASCL1P50553 236 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ACTA2P62736 377 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ACTG2P63267 376 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ADAM8P78325 824 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SLC35A2P78381 396 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 MVKQ03426 396 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 FMODQ06828 376 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 FOXF2Q12947 444 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 AQP6Q13520 282 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SGCAQ16586 387 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 LINC01590Q5TEZ4 76 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 VWA1Q6PCB0 445 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 KLHL24Q6TFL4 600 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 GABRG1Q8N1C3 465 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SVOPQ8N4V2 548 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 NAXEQ8NCW5 288 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 OR51G2Q8NGK0 314 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 LILRB4Q8NHJ6 448 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 NSMAFQ92636 917 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 C1orf198Q9H425 327 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 NIPAL2Q9H841 368 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 MED20Q9H944 212 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 WDR76Q9H967 626 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 FKBP14Q9NWM8 211 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 JKAMPQ9P055 326 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 POLR1DQ9Y2S0 133 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SNX5Q9Y5X3 404 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 A0A087WXM4 84 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 DAPL1A0PJW8 107 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 CCDC182A6NF36 153 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 PTGES3LE9PB15 166 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 M0R129 80 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 DCTN6O00399 190 aa8.19□□□□□ -1.1
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CS-220ENST00000550700 ZNF254O75437 659 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 SULT1C4O75897 302 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 IGHA1P01876 353 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 GYPBP06028 91 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 CDK1P06493 297 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 TACSTD2P09758 323 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 GAAP10253 952 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 GNLYP22749 145 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-220ENST00000550700 IL32P24001 234 aa8.19□□□□□ -1.1
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