RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TNFRSF11BO00300 401 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SLC2A10O95528 541 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 HLA-HP01893 362 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CELA3BP08861 270 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CBR1P16152 277 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 LIMS1P48059 325 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ATP5J2P56134 94 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 FMODQ06828 376 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CD47Q08722 323 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 NPRL3Q12980 569 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 HIST3H3Q16695 136 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ANKDD1AQ495B1 522 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MDP1Q86V88 176 aa8.36□□□□□ -1.07
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CS-217ENST00000550044 ZNF611Q8N823 705 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 NSMAFQ92636 917 aa8.36□□□□□ -1.07
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CS-217ENST00000550044 Q96M85 177 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SLC38A2Q96QD8 506 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SH3GL3Q99963 347 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 KATNB1Q9BVA0 655 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MAGIXQ9H6Y5 334 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 OBP2BQ9NPH6 170 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MOKQ9UQ07 419 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MGAT4BQ9UQ53 548 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 LAMP3Q9UQV4 416 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 U3KQV3 271 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ROS1P08922 2347 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 E7EQL1 145 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 H7C1C5 153 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PRODHO43272 600 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CD5LO43866 347 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 KRT36O76013 467 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 NDUFB2O95178 105 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SOD3P08294 240 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CD14P08571 375 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CECR9P0C854 216 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 FAM157CP0CG43 387 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CDAP32320 146 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZNF84P51523 738 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 HMGA2P52926 109 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CDH11P55287 796 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 FXYD6P3P58550 94 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 LCN6P62502 163 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TAF11Q15544 211 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 PGGHGQ32M88 737 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 B3GLCTQ6Y288 498 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SPATA24Q86W54 205 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 LRRC18Q8N456 261 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 OR2T29Q8NH02 315 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TMEM171Q8WVE6 324 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 RBP7Q96R05 134 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 CHID1Q9BWS9 393 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 NOX3Q9HBY0 568 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 VNN3Q9NY84 501 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ZNF224Q9NZL3 707 aa8.35□□□□□ -1.07
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CS-217ENST00000550044 POMPQ9Y244 141 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 NPIPB13A6NJU9 1138 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 AQP12BA6NM10 295 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 NPIPB4C9JG80 1138 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 SOCS2O14508 198 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 KCNAB3O43448 404 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 ATP5HO75947 161 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 GASTP01350 101 aa8.34□□□□□ -1.07
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CS-217ENST00000550044 CRYAAP02489 173 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-217ENST00000550044 DANCRP0C864 163 aa8.34□□□□□ -1.07
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