RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa7.2□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.2□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 SLAMF8Q9P0V8 285 aa7.2□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 ZNF229Q9UJW7 825 aa7.2□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.2□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.19□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 CENPBD1B2RD01 187 aa7.19□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 SPRY3O43610 288 aa7.19□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 TPST2O60704 377 aa7.19□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 FOXH1O75593 365 aa7.19□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 MFN2O95140 757 aa7.19□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 IGHV2-5P01817 119 aa7.19□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 PGA4P0DJD7 388 aa7.19□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 PGA3P0DJD8 388 aa7.19□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 TNFSF4P23510 183 aa7.19□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 STOMP27105 288 aa7.19□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 ARL9Q6T311 187 aa7.19□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.19□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 C1QL4Q86Z23 238 aa7.19□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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TROAP-208ENST00000548817 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa7.17□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.17□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TROAP-208ENST00000548817 TRMUO75648 421 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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