RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 IFT27Q9BW83 186 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 EGLN1Q9GZT9 426 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGIXQ9H6Y5 334 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF556Q9HAH1 456 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NOX3Q9HBY0 568 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 C20orf141Q9NUB4 165 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 B3GNT2Q9NY97 397 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NDUFAF4Q9P032 175 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RHCGQ9UBD6 479 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP13Q9UII6 198 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAM21Q9UKJ8 722 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 BAIAP2Q9UQB8 552 aa4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV27A0A087WT01 109 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A087WUU8 490 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PRSS37A4D1T9 235 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 C5orf49A4QMS7 147 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF223E7ERA6 249 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LRRN3E7EW58 273 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF11BO00300 401 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ARPC2O15144 300 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SURF4O15260 269 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 GYG2O15488 501 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CD5LO43866 347 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CCNB2O95067 398 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LYPD3O95274 346 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 IFNGP01579 166 aa4.85□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 RAP2AP10114 183 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 COX5BP10606 129 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF35P13682 527 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 DAOP14920 347 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NCK1P16333 377 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PAICSP22234 425 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 FPR3P25089 353 aa4.85□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CHN2P52757 468 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CRYBA2P53672 197 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH15P55291 814 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 UCP2P55851 309 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM33P57088 247 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LSM6P62312 80 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A3Q00325 362 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SPOCK1Q08629 439 aa4.85□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 COX10Q12887 443 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN31Q12999 210 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 AQP6Q13520 282 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB39AQ14964 217 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ARMC4Q5T2S8 1044 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 LINGO2Q7L985 606 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SKA3Q8IX90 412 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF148Q8N7C7 305 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ICA1LQ8NDH6 482 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 OR52J3Q8NH60 311 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 FANK1Q8TC84 345 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC7A13Q8TCU3 470 aa4.85□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 NSMAFQ92636 917 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 NEUROG1Q92886 237 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ASB9Q96DX5 294 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX18Q96RF0 628 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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CLSTN3-215ENST00000544584 KCNK17Q96T54 332 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SEPHS2Q99611 448 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SH3GL3Q99963 347 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF416Q9BWM5 594 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PRRG3Q9BZD7 231 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 REEP1Q9H902 201 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 SP140LQ9H930 580 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CD300AQ9UGN4 299 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ENOPH1Q9UHY7 261 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.85□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa4.84□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 OR6C6A6NF89 314 aa4.84□□□□□ -1.63
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM64A6NGJ6 449 aa4.84□□□□□ -1.63
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