RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM163	Q8TC26	289 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	S100PBP	Q96BU1	408 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		13.4	□□□□□ -0.26
BBS1-224	ENST00000534730	HCFC1	P51610	2035 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730		H7C1C5	153 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SLC2A10	O95528	541 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CST2	P09228	141 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	EPX	P11678	715 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	COX6B1	P14854	86 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CTLA4	P16410	223 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CAPZA2	P47755	286 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	NR1H2	P55055	460 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	LCN6	P62502	163 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	POU4F2	Q12837	409 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SNCB	Q16143	134 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	KCNMB1	Q16558	191 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SGCA	Q16586	387 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	OR6V1	Q8N148	313 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CYGB	Q8WWM9	190 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730		Q9H521	79 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	NF1	P21359	2839 aa		13.39	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	GLCE	O94923	617 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	RAB36	O95755	333 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	B4GALT1	P15291	398 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SPI1	P17947	270 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	IGFBP2	P18065	325 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	EDNRA	P25101	427 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CAPG	P40121	348 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	FMOD	Q06828	376 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	GSG1	Q2KHT4	349 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	LINGO2	Q7L985	606 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	SHF	Q7M4L6	423 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	DDO	Q99489	341 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	MNT	Q99583	582 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ADI1	Q9BV57	179 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	RNF121	Q9H920	327 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	IRGM	A1A4Y4	181 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	CD79A	P11912	226 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TEK	Q02763	1124 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	AQP6	Q13520	282 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	BEX5	Q5H9J7	111 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	MBOAT4	Q96T53	435 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BBS1-224	ENST00000534730	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		13.37	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms