RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 ZNF45Q02386 682 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 RELAQ04206 551 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 SERTAD2Q14140 314 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 ITIH4Q14624 930 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 GANABQ14697 944 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 TMEM249Q2WGJ8 235 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 DEFB115Q30KQ5 88 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 GCSAMLQ5JQS6 135 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 SLX4IPQ5VYV7 408 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 LPCAT4Q643R3 524 aa2.74□□□□□ -1.97
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