RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529757.5

PACS1-209, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 1,688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-209ENST00000529757 BCO1Q9HAY6 547 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-209ENST00000529757 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-209ENST00000529757 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-209ENST00000529757 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-209ENST00000529757 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-209ENST00000529757 STUB1Q9UNE7 303 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-209ENST00000529757 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-209ENST00000529757 DNAJC13O75165 2243 aa14.71□□□□□ -0.05
PACS1-209ENST00000529757 METTL15A6NJ78 407 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 PSMD9O00233 223 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 DHHO43323 396 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SULT1C4O75897 302 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 GABRA5P31644 462 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 VBP1P61758 197 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 KCNMB1Q16558 191 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 AMELYQ99218 206 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 LUZP4Q9P127 313 aa14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 IGF2RP11717 2491 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 A0A1B0GTH9 108 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 A0A1W2PPW3 197 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 OR14I1A6ND48 311 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 GPX5O75715 221 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 YES1P07947 543 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 OR8G3PP0DMU2 310 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 PCSK6P29122 969 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CDAP32320 146 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ZNF84P51523 738 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 NCS1P62166 190 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 NFATC3Q12968 1075 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SPCS2Q15005 226 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 RPTNQ6XPR3 784 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 OR8B4Q96RC9 309 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ABHD6Q9BV23 337 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CALHM2Q9HA72 323 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 EMC7Q9NPA0 242 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 POLE4Q9NR33 117 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa14.7□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 UPK3AO75631 287 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ABHD16AO95870 558 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 TGM6O95932 706 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 FAM87AP0C7U9 286 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CRYBB2P43320 205 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SIRPAP78324 504 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ROM1Q03395 351 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CCDC58Q4VC31 144 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ARL9Q6T311 187 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 LINC00346Q8IVM7 164 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 OR52N5Q8NH56 324 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 TMEM203Q969S6 136 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 GPR137Q96N19 417 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CENPOQ9BU64 300 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 GP6Q9HCN6 339 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SSR3Q9UNL2 185 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.69□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 HSPB2A8KAH6 182 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 OGG1O15527 345 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 PLPP2O43688 288 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 CD53P19397 219 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 MSR1P21757 451 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 PSMB10P40306 273 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 TGM4P49221 684 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 HSPB2Q16082 182 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 LIPNQ5VXI9 398 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 DCXRQ7Z4W1 244 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 KRT77Q7Z794 578 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 NDNFQ8TB73 568 aa14.68□□□□□ -0.06
PACS1-209ENST00000529757 ST7LQ8TDW4 575 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms