RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 FAM46BQ96A09 425 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 NEURL2Q9BR09 285 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa10.52□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 RER1O15258 196 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 LMX1BO60663 402 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 KRT33AO76009 404 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 EPXP11678 715 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 HSD11B1P28845 292 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 CD83Q01151 205 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 Q0VFX4 171 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 TAAR9Q96RI9 348 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.735e-8■■□□□ 12
PTPRK-216ENST00000524481 A3GALT2U3KPV4 340 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 NPIPB7O75200 414 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 PTGDSP41222 190 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 DAP3P51398 398 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 PLGLB1Q02325 96 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 HSF2Q03933 536 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 IL10RAQ13651 578 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ALKBH2Q6NS38 261 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 FAAP20Q6NZ36 180 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 KLHL24Q6TFL4 600 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 RAB43Q86YS6 212 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 BEST4Q8NFU0 473 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 MFSD8Q8NHS3 518 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 C11orf40Q8WZ69 217 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 MRGPRX4Q96LA9 322 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 LRP12Q9Y561 859 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 FKBP7Q9Y680 259 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 FREM1Q5H8C1 2179 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ARGFXA6NJG6 315 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 CXCL13O43927 109 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 CCNOP22674 350 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ACP1P24666 158 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 TIGD3Q6B0B8 471 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 SYS1Q8N2H4 156 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 UXS1Q8NBZ7 420 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 STK35Q8TDR2 534 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 GPR148Q8TDV2 347 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 B3GNT4Q9C0J1 378 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 WDR54Q9H977 334 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 DHDHQ9UQ10 334 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 SLC5A6Q9Y289 635 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 V9GY05 133 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 DCHS1Q96JQ0 3298 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 POLEQ07864 2286 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 C3AR1Q16581 482 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 CDC20BQ86Y33 519 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 PRSS35Q8N3Z0 413 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 OR13C3Q8NGS6 347 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 PRRG4Q9BZD6 226 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 NOTOA8MTQ0 251 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 FTCDNL1E5RQL4 147 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 UPK3AO75631 287 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 GUSBP08236 651 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 LAP3P28838 519 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 PITPNBP48739 271 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 SLC25A1P53007 311 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 DGCR2P98153 550 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 SLC17A1Q14916 467 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 Q499Y3 187 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 EMC4Q5J8M3 183 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 LYPD8Q6UX82 237 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 OR8S1Q8NH09 359 aa10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ISPDA4D126 451 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 OGG1O15527 345 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 IGHG1P01857 330 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 CSN2P05814 226 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 APEHP13798 732 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ETV6P41212 452 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 NR4A2P43354 598 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 CDCP2Q5VXM1 449 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 DNM1P34Q6PK57 102 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 STAC2Q6ZMT1 411 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 AKAP14Q86UN6 197 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF679Q8IYX0 411 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF283Q8N7M2 679 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 SYNPRQ8TBG9 265 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRK-216ENST00000524481 SLC22A4Q9H015 551 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms