RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 LHFPL3Q86UP9 236 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NAA40Q86UY6 237 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ECHDC2Q86YB7 292 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCDC50Q8IVM0 306 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRSS58Q8IYP2 241 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF101Q8IZC7 436 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC35G3Q8N808 338 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MSANTD4Q8NCY6 345 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PIFOQ8TCI5 191 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAIP1Q8WWC4 291 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM54Q969K7 222 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM3DQ96BQ1 224 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 WDR34Q96EX3 536 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TGM7Q96PF1 710 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MS4A4EQ96PG1 132 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM111AQ96PZ2 611 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLCC1Q96S66 551 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF607Q96SK3 696 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NPY6RQ99463 290 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SORT1Q99523 831 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 P2RX4Q99571 388 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TIMM17AQ99595 171 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 OMDQ99983 421 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SPXQ9BT56 116 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TCHPQ9BT92 498 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 HSD3B7Q9H2F3 369 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 LRRN3Q9H3W5 708 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 C1orf198Q9H425 327 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ELOVL3Q9HB03 270 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PARP11Q9NR21 331 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 C8orf17Q9NRJ1 99 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NINJ2Q9NZG7 142 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMOD2Q9NZR1 351 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 EPS15L1Q9UBC2 864 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SHPKQ9UHJ6 478 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ENOPH1Q9UHY7 261 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NCKAP5O14513 1909 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PNPLA6Q8IY17 1366 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 COL4A1P02462 1669 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM131Q92545 1883 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDHR2Q9BYE9 1310 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NUMA1Q14980 2115 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRAV6A0A075B6T7 132 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 A0A087WZY1 265 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SDHAF1A6NFY7 115 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM47DPA6NHR8 397 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 OR6C70A6NIJ9 312 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CEACAM18A8MTB9 384 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 E7EQL1 145 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MANBAO00462 879 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRRG1O14668 218 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CLDN3O15551 220 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MED7O43513 233 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CHST10O43529 356 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TOM1O60784 492 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 REM1O75628 298 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CNMDO75829 334 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NDUFB10O96000 172 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 HEXBP07686 556 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CALCBP10092 127 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF35P13682 527 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PSMB5P28074 263 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 LOXP28300 417 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 LAP3P28838 519 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CASP14P31944 242 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCR1P32246 355 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CA8P35219 290 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RDXP35241 583 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 FDFT1P37268 417 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 IDH2P48735 452 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 UGT2B15P54855 530 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAS2R31P59538 309 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 PPP1CBP62140 327 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CRADDP78560 199 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 DEFB103AP81534 67 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDK16Q00536 496 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF92Q03936 586 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 CDH17Q12864 832 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 SELPLGQ14242 412 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-448P-201ENST00000517052 MESDQ14696 234 aa0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms