RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 CA6P23280 308 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PTPN6P29350 595 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 MNDAP41218 407 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 SKP1P63208 163 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 MYBPC1Q00872 1141 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 RIGQ13278 110 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 TMED2Q15363 201 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 STX1AQ16623 288 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GPR33Q49SQ1 333 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 FAM182AQ5T1J6 154 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 UGT3A1Q6NUS8 523 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF343Q6P1L6 599 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 HSDL2Q6YN16 418 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 Q6ZRP5 223 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 CHMP1BQ7LBR1 199 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 SERPINA9Q86WD7 417 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 MCOLN2Q8IZK6 566 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF525Q8N782 197 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 MINDY2Q8NBR6 621 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 APCDD1LQ8NCL9 501 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 OR4K1Q8NGD4 311 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 OR2A1Q8NGT9 310 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 NCLNQ969V3 563 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 FOPNLQ96NB1 174 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 DOHHQ9BU89 302 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 CLEC7AQ9BXN2 247 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 CRLF2Q9HC73 371 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GLRX2Q9NS18 164 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 CLEC4AQ9UMR7 237 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 HEY1Q9Y5J3 304 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ABCA1O95477 2261 aa3.73□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD12Q6UB98 2062 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 A0A1W2PNV4 684 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 FRG2CA6NGY1 282 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 H0YIV9 168 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 CDC7O00311 574 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 HAT1O14929 419 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 EPOP01588 193 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 YES1P07947 543 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GSTA2P09210 222 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 NUDT17P0C025 328 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PCMT1P22061 227 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PAX7P23759 505 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 HTR2AP28223 471 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 BDKRB1P46663 353 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PRRX1P54821 245 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP12-2P59991 146 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 BTG2P78543 158 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 XIAPP98170 497 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 PDK3Q15120 406 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 HADHQ16836 314 aaKnown RBP3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ARMCX4Q5H9R4 360 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 OR2A2Q6IF42 318 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF774Q6NX45 483 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ENPP6Q6UWR7 440 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GPR141Q7Z602 305 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 SLC22A15Q8IZD6 547 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 SMYD1Q8NB12 490 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 OR5T3Q8NGG3 340 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 OR13C4Q8NGS5 318 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 GIPC3Q8TF64 312 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ASZ1Q8WWH4 475 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 TADA1Q96BN2 335 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 OMA1Q96E52 524 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF597Q96LX8 424 aa3.72□□□□□ -1.81
PDE4D-217ENST00000509355 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms