RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP2R2BQ00005 443 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PIGFQ07326 219 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 NPRL3Q12980 569 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNMB1Q16558 191 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 OR6V1Q8N148 313 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC37A3Q8NCC5 494 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 DDOQ99489 341 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 C9orf16Q9BUW7 83 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
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SH3BP2-212ENST00000508338 SAC3D1A6NKF1 404 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 HS3ST1O14792 307 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINA5P05154 406 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ETFDHQ16134 617 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa23.33■■□□□ 1.33
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SH3BP2-212ENST00000508338 NINJ1Q92982 152 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 PLEKHA8Q96JA3 519 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 POU2F3Q9UKI9 436 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-212ENST00000508338 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa23.33■■□□□ 1.33
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SH3BP2-212ENST00000508338 ERICH4A6NGS2 130 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 TMCC2O75069 709 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 KRTAP10-9P60411 292 aa23.32■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 HSF2Q03933 536 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 SCRN3Q0VDG4 424 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF611Q8N823 705 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF75AQ96N20 296 aa23.32■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 USE1Q9NZ43 259 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 KCNG2Q9UJ96 466 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 SPEF1Q9Y4P9 236 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 SHISA9B4DS77 424 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 AQP6Q13520 282 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 DAG1Q14118 895 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 CRMP1Q14194 572 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 IQCF1Q8N6M8 205 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 PROKR2Q8NFJ6 384 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 OR10H5Q8NGA6 315 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 TSSK2Q96PF2 358 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 UBTD1Q9HAC8 227 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 NOTCH2Q04721 2471 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A1W2PPR1 153 aa23.3■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 BAG2O95816 211 aa23.3■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 RAD23AP54725 363 aa23.3■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 CYB561A3Q8NBI2 242 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 KBTBD8Q8NFY9 601 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXO17Q96EF6 278 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 CIB1Q99828 191 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF416Q9BWM5 594 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 GABARAPL3Q9BY60 117 aa23.3■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 NOX3Q9HBY0 568 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 PLAUP00749 431 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 GAAP10253 952 aa23.29■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB39AQ14964 217 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 FGFBP3Q8TAT2 258 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 HTRA1Q92743 480 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 FN3KQ9H479 309 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 POLR1DQ9Y2S0 133 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 TACC2O95359 2948 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 HLA-DQA2P01906 255 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 RAF1P04049 648 aa23.28■■□□□ 1.32
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SH3BP2-212ENST00000508338 PATE4P0C8F1 98 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 DNASE1P24855 282 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 APLNRP35414 380 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 TBC1D28Q2M2D7 210 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF544Q6NX49 715 aa23.28■■□□□ 1.32
SH3BP2-212ENST00000508338 CDH24Q86UP0 819 aa23.28■■□□□ 1.32
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