RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 VRK2Q86Y07 508 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 FITM2Q8N6M3 262 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HTRA1Q92743 480 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PTP4A1Q93096 173 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RASD2Q96D21 266 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PANX1Q96RD7 426 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OPA3Q9H6K4 179 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 A0A096LPE4 126 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PPZ6 126 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ATP8B1O43520 1251 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SERPINB7O75635 380 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CYP7B1O75881 506 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HLA-HP01893 362 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NAT2P11245 290 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PSMB10P40306 273 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NXNQ6DKJ4 435 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF583Q96ND8 569 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 C12orf71A8MTZ7 269 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF879B4DU55 563 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SDHDO14521 159 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OPN1MWP04001 364 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CD79AP11912 226 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ACADSP16219 412 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 FAHP16930 419 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 DRD4P21917 467 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 STOMP27105 288 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CD80P33681 288 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GUCA2AQ02747 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 VHLLQ6RSH7 139 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HIPK4Q8NE63 616 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GAL3ST1Q99999 423 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 RAB18Q9NP72 206 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.45□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 WNT5AP41221 380 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GIPRP48546 466 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SLC9A3P48764 834 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1CBP62140 327 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 COL10A1Q03692 680 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 BST1Q10588 318 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR1Q1Q15612 314 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 GCNT6Q5T4J0 391 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 HDXQ7Z353 690 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MCHR2Q969V1 340 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR52E6Q96RD3 313 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SIRPDQ9H106 197 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 KIF17Q9P2E2 1029 aa6.45□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 PLSCR5A0PG75 271 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 M0R3G1 203 aa6.44□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 XPNPEP2O43895 674 aa6.44□□□□□ -1.38
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PDE4D-210ENST00000503258 GDI2P50395 445 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TUBA1BP68363 451 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TUBA4AP68366 448 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SPIBQ01892 262 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 TUBA1AQ71U36 451 aa6.44□□□□□ -1.38
PDE4D-210ENST00000503258 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.44□□□□□ -1.38
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