RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 DLC1Q96QB1 1528 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 C1orf167Q5SNV9 1468 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 NOS1P29475 1434 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CEP162Q5TB80 1403 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ERBINQ96RT1 1412 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 NKX2-6A6NCS4 301 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ERVV-1B6SEH8 477 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 LAD1O00515 517 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 HMMRO75330 724 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 IGKV3-11P04433 115 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 IGKV1-13P0DP09 117 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF24P17028 368 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 NMUP48645 174 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 LHX2P50458 406 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CCR6P51684 374 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ECH1Q13011 328 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 IDI1Q13907 227 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 SGCAQ16586 387 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 GUCA2BQ16661 112 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 LCE3AQ5TA76 89 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF836Q6ZNA1 936 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 C6orf120Q7Z4R8 191 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 EID2Q8N6I1 236 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 GPR151Q8TDV0 419 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC126Q96EE4 140 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 GABARAPL3Q9BY60 117 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 FAM192AQ9GZU8 254 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF226Q9NYT6 803 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 GNPTGQ9UJJ9 305 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 WSB1Q9Y6I7 421 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 NRAPQ86VF7 1730 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 IQGAP3Q86VI3 1631 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ADGRL2O95490 1459 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1B0GVI7 797 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 SMCO3A2RU48 225 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 PRSS37A4D1T9 235 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 SMCO2A6NFE2 343 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 PES1O00541 588 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 PEX7O00628 323 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 DLGAP1O14490 977 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 XKRYO14609 159 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 SUPT3HO75486 399 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CALM1P0DP23 149 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CALM2P0DP24 149 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CALM3P0DP25 149 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 AK4P27144 223 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CDKN1BP46527 198 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 TFPI2P48307 235 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CCR8P51685 355 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ACLYP53396 1101 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 GPX6P59796 221 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ACTA2P62736 377 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 RPS21P63220 83 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ACTG2P63267 376 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ACTC1P68032 377 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ACTA1P68133 377 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF92Q03936 586 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 RCN1Q15293 331 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 XKR7Q5GH72 579 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 PIGGQ5H8A4 983 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 PRAMEF20Q5VT98 475 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 LIX1Q8N485 282 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 MS4A15Q8N5U1 240 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 MDS2Q8NDY4 140 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 OR1S2Q8NGQ3 325 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 RHEBL1Q8TAI7 183 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 PIBF1Q8WXW3 757 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 KIFAP3Q92845 792 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM54Q969K7 222 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ATP5SQ99766 215 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 OSBPL10Q9BXB5 764 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 DNTTIP1Q9H147 329 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 UGT1A7Q9HAW7 530 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 UGT1A10Q9HAW8 530 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 UGT1A8Q9HAW9 530 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 CTPS2Q9NRF8 586 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 RAB26Q9ULW5 256 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRK-215ENST00000498284 PXDNQ92626 1479 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRK-215ENST00000498284 KIF1AQ12756 1690 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF726A6NNF4 738 aa2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms