RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493583.5

TFE3-204, Transcript of transcription factor binding to IGHM enhancer 3, human

TSL 2

Gene TFE3, Length 3,279 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TFE3-204	ENST00000493583	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	NUBPL	Q8TB37	319 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	MIB2	Q96AX9	1013 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SPACA6	W5XKT8	324 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	NCOR1	O75376	2440 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	TMEM82	A0PJX8	343 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SIGLEC6	O43699	453 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	PRAMEF2	O60811	474 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	GPR75	O95800	540 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	S100A6	P06703	90 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	ZNF425	Q6IV72	752 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583		Q6ZS52	159 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SPSB2	Q99619	263 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	BIN3	Q9NQY0	253 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	PRSS38	A1L453	326 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583		K7EQS6	105 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	WDPCP	O95876	746 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	GRK6	P43250	576 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	COL19A1	Q14993	1142 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	TRAM1	Q15629	374 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	TCEAL3	Q969E4	200 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	ADO	Q96SZ5	270 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	RNF224	P0DH78	156 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SPP1	P10451	314 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	MAP3K8	P41279	467 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	CXADR	P78310	365 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	BLOC1S1	P78537	153 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	KLHL26	Q53HC5	615 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	RSC1A1	Q92681	617 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	APMAP	Q9HDC9	416 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	CTSF	Q9UBX1	484 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	MPTX1	A8MV57	137 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	PRAF2	O60831	178 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	UPK3A	O75631	287 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	OR6A2	O95222	327 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	HP	P00738	406 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SLC2A1	P11166	492 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	GNAL	P38405	381 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	FAM71C	Q8NEG0	241 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	TEX101	Q9BY14	249 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	PTPRS	Q13332	1948 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	CARNS1	A5YM72	827 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	OR2A4	O95047	310 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	DHRS2	Q13268	280 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TFE3-204	ENST00000493583	OR2A7	Q96R45	310 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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