RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB1A	P62820	205 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVK-25	P63136	954 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CD47	Q08722	323 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	COX10	Q12887	443 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DAG1	Q14118	895 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RFX4	Q33E94	735 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	THEM4	Q5T1C6	240 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT14	Q8NB59	555 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF570	Q96NI8	536 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ALG12	Q9BV10	488 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NOX3	Q9HBY0	568 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CMAHP	Q9Y471	501 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	JMJD1C	Q15652	2540 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ABCA1	O95477	2261 aa		14.94	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IDH3B	O43837	385 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB36	O95755	333 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GAST	P01350	101 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CAPZA2	P47755	286 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBA1B	P68363	451 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBA4A	P68366	448 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TUBA1A	Q71U36	451 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF525	Q8N782	197 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NRBF2	Q96F24	287 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IFT27	Q9BW83	186 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RTTN	Q86VV8	2226 aa		14.93	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IMPA2	O14732	288 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TIPRL	O75663	272 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HLA-H	P01893	362 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CD79A	P11912	226 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ANXA8	P13928	327 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	B4GALT1	P15291	398 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GIF	P27352	417 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SDHA	P31040	664 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	THBS4	P35443	961 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CCNI	Q14094	377 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf128	Q5T292	105 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MCHR2	Q969V1	340 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	OR52D1	Q9H346	318 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		14.92	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM129	A0AVI4	362 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNGR3	O43761	229 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CELA3B	P08861	270 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NR4A2	P43354	598 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GZMK	P49863	264 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ACTR3	P61158	418 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NPRL3	Q12980	569 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FHL1	Q13642	323 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC36A2	Q495M3	483 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCK1	Q86TW2	530 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SKA3	Q8IX90	412 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SAMD8	Q96LT4	415 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FEV	Q99581	238 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GPA33	Q99795	319 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	WAC	Q9BTA9	647 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX12	Q9BXU0	123 aa		14.91	□□□□□ -0.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		14.91	□□□□□ -0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms