RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 EFNB3Q15768 340 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A7Q8NEW0 376 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 RTTNQ86VV8 2226 aa18.08■□□□□ 0.49
ACTB-211ENST00000480301 TRIM64A6NGJ6 449 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 TRIM64BA6NI03 449 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 B9A039 149 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GPRIN2O60269 458 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A7O60669 478 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CCL2P13500 99 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 MSR1P21757 451 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PSG4Q00888 419 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GK3PQ14409 553 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 MSMPQ1L6U9 139 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa18.08■□□□□ 0.48
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ACTB-211ENST00000480301 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF416Q9BWM5 594 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 DGCR6LQ9BY27 220 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 NUAK2Q9H093 628 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 C1orf198Q9H425 327 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PLK3Q9H4B4 646 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 EGLN3Q9H6Z9 239 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 IL20Q9NYY1 176 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CDH10Q9Y6N8 788 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa18.07■□□□□ 0.48
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ACTB-211ENST00000480301 VSTM5A8MXK1 200 aa18.07■□□□□ 0.48
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ACTB-211ENST00000480301 BMP4P12644 408 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 FOSL1P15407 271 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 APEX1P27695 318 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
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ACTB-211ENST00000480301 HSF2Q03933 536 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PLP2Q04941 152 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 DNM1P46Q6ZS02 220 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OR4K13Q8NH42 304 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SLCO4A1Q96BD0 722 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OR2H1Q9GZK4 316 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 WNT5BQ9H1J7 359 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 EMC7Q9NPA0 242 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SPEF1Q9Y4P9 236 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
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ACTB-211ENST00000480301 BHLHE40O14503 412 aa18.06■□□□□ 0.48
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ACTB-211ENST00000480301 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 ERFP50548 548 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GALK2Q01415 458 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 RAB35Q15286 201 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 LEG1Q6P5S2 330 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 JAZF1Q86VZ6 243 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OR10G2Q8NGC3 310 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OR8D4Q8NGM9 314 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 OR1J2Q8NGS2 313 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 AKR7LQ8NHP1 331 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 TSSK2Q96PF2 358 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SNX18Q96RF0 628 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 NMNAT3Q96T66 252 aa18.06■□□□□ 0.48
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ACTB-211ENST00000480301 CMAHPQ9Y471 501 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 DCTN6O00399 190 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SNAP29O95721 258 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 TP53P04637 393 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CRABP1P29762 137 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 APLNRP35414 380 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 PCBD1P61457 104 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 CBX1P83916 185 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D28Q2M2D7 210 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 SYT9Q86SS6 491 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GLB1L2Q8IW92 636 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 GIPC3Q8TF64 312 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 C18orf12Q96KH6 178 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 POM121L2Q96KW2 1035 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 WACQ9BTA9 647 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTB-211ENST00000480301 BDH2Q9BUT1 245 aa18.05■□□□□ 0.48
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