RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 LPAR2Q9HBW0 351 aa2.21□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 NT5MQ9NPB1 228 aa2.21□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 UBAP1Q9NZ09 502 aa2.21□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PSMD13Q9UNM6 376 aa2.21□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa2.21□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 TANC1Q9C0D5 1861 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CHD5Q8TDI0 1954 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 A0A087WZY1 265 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 A0A0D9SEW6 157 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 LOC100653049A0A140TA62 436 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PRORSD1PA6NEY8 169 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SAGE2PA6NJ88 616 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM74A7A6NL05 159 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 UBXN8O00124 270 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 NME4O00746 187 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 AIM2O14862 343 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 AZIN1O14977 448 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 UBDO15205 165 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 DENRO43583 198 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 KDELR3O43731 214 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 DUX1O43812 170 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ECI2O75521 394 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 KRT34O76011 436 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CDK14O94921 469 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CD160O95971 181 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 FGF4P08620 206 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 RBP1P09455 135 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC166P0CW27 439 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 THRAP10827 490 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ANXA3P12429 323 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 UQCRBP14927 111 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 IMPDH1P20839 514 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CD9P21926 228 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ME2P23368 584 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CA5AP35218 305 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 DLSTP36957 453 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 XCR1P46094 333 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 OR1G1P47890 313 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PLK1P53350 603 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 FOXA1P55317 472 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 RPL8P62917 257 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 GNA12Q03113 381 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ASPHQ12797 758 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SMARCB1Q12824 385 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF154Q13106 437 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SCGB2A2Q13296 93 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 FLOT2Q14254 428 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 GK3PQ14409 553 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF235Q14590 738 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PDK3Q15120 406 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CYTH1Q15438 398 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CYP51A1Q16850 503 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM83EQ2M2I3 478 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM74A3Q4VXF1 159 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 LIN52Q52LA3 116 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 COQ5Q5HYK3 327 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CTSL3PQ5NE16 218 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 C10orf120Q5SQS8 335 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF678Q5SXM1 525 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC22A10Q63ZE4 541 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CLEC6AQ6EIG7 209 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC8B1Q6J4K2 584 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 LCN8Q6JVE9 175 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ZFP1Q6P2D0 407 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 NIPAL3Q6P499 406 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 AFTPHQ6ULP2 937 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CBLN3Q6UW01 205 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ARSKQ6UWY0 536 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 IGFL3Q6UXB1 125 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 LANCL3Q6ZV70 420 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM150AQ86TG1 271 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC22A9Q8IVM8 553 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 PIANPQ8IYJ0 282 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CSNK1A1LQ8N752 337 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 SNX31Q8N9S9 440 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 ZBTB44Q8NCP5 570 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 OR9I1Q8NGQ6 314 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 OR13C4Q8NGS5 318 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 RHEBL1Q8TAI7 183 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 NANPQ8TBE9 248 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM110BQ8TC76 370 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 CD200R1Q8TD46 325 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
ANKRD28-210ENST00000479043 FBXO32Q969P5 355 aa2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms