RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	CD79A	P11912	226 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	NR2C1	P13056	603 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	COL8A2	P25067	703 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	FPR2	P25090	351 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	OR1E2	P47887	323 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	PPOX	P50336	477 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	SEC24C	P53992	1094 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	BID	P55957	195 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	CLRN1	P58418	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	TUBA1B	P68363	451 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	TUBA4A	P68366	448 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	EGR4	Q05215	589 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	LIPE	Q05469	1076 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	GABRA6	Q16445	453 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ZNF74	Q16587	644 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	FXN	Q16595	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	SLC25A28	Q96A46	364 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	SGTB	Q96EQ0	304 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	OR2M2	Q96R28	347 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	EMC6	Q9BV81	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	TPK1	Q9H3S4	243 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	IL20	Q9NYY1	176 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953		V9GYQ6	96 aa		4.99	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953		B9A039	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	LRRN3	E7EW58	273 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	PLPP3	O14495	311 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	OR7A10	O76100	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	MPZL1	O95297	269 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	SERPINA1	P01009	418 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	FAM157B	P0CG42	384 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	B4GALT1	P15291	398 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	PRDX6	P30041	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	KDELR2	P33947	212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	NTF4	P34130	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	GSK3B	P49841	420 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ZNF84	P51523	738 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	P2RY4	P51582	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	PSME3	P61289	254 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	GALK2	Q01415	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	CD47	Q08722	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	MELK	Q14680	651 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
VARS-222	ENST00000470953	PXK	Q7Z7A4	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61

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