RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	FGF11	Q92914	225 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	HSFY1	Q96LI6	401 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	OXGR1	Q96P68	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KCNA7	Q96RP8	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBBP4-208	ENST00000463378	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ASTN1	O14525	1302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378		I3L4J1	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GOSR2	O14653	212 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MBTPS2	O43462	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	FKBP6	O75344	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SPAG7	O75391	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2F2	O95006	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PSMG1	O95456	288 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	HMOX2	P30519	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RANBP1	P43487	201 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CXCL6	P80162	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378		Q6ZN92	141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	OR2L2	Q8NH16	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	OPTN	Q96CV9	577 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CCDC126	Q96EE4	140 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GBA3	Q9H227	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378		Q9H521	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GIN1	Q9NXP7	522 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378		V9GY05	133 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CACNA1S	Q13698	1873 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM25E	A8MYX2	175 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	DLGAP1	O14490	977 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PFDN1	O60925	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	FGF1	P05230	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF43	P17038	809 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	NPR2	P20594	1047 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC2A5	P22732	501 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	FOXN2	P32314	431 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GSS	P48637	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	XIAP	P98170	497 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ZNF677	Q86XU0	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms