RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
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SMKR1-201ENST00000462322 CST2P09228 141 aa20.64■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 FAM157BP0CG42 384 aa20.64■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 IFNGR2P38484 337 aa20.64■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 EVX1P49640 407 aa20.64■□□□□ 0.89
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SMKR1-201ENST00000462322 C10orf105Q8TEF2 133 aa20.64■□□□□ 0.89
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SMKR1-201ENST00000462322 OR51B6Q9H340 312 aa20.64■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.64■□□□□ 0.89
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SMKR1-201ENST00000462322 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF416Q9BWM5 594 aa20.62■□□□□ 0.89
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SMKR1-201ENST00000462322 A0A1W2PPW3 197 aa20.6■□□□□ 0.89
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SMKR1-201ENST00000462322 APEHP13798 732 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
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SMKR1-201ENST00000462322 MAGEA2P43356 314 aa20.6■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 GSSP48637 474 aa20.6■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 GDI2P50395 445 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 HMGA2P52926 109 aa20.6■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf94Q6P1W5 598 aa20.6■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.6■□□□□ 0.89
SMKR1-201ENST00000462322 PTCHD4Q6ZW05 846 aa20.6■□□□□ 0.89
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