RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 MOB2Q70IA6 237 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ISCA2Q86U28 154 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 DEFB123Q8N688 67 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SNX31Q8N9S9 440 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2L8Q8NGY9 312 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 UFD1Q92890 307 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 BCORQ6W2J9 1755 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PRF3 423 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1W2PRM7 423 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC22A20A6NK97 555 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 TRDCB7Z8K6 153 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 PLPP1O14494 284 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 RAD51BO15315 384 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SEC24AO95486 1093 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV4-39P01824 125 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 RPSAP08865 295 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXB7P09629 217 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 PATE4P0C8F1 98 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 MLNP12872 115 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 RNH1P13489 461 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 DAP3P51398 398 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 STX5Q13190 355 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM189A2Q15884 450 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 RGS21Q2M5E4 152 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 PGAP1Q75T13 922 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 CRLF3Q8IUI8 442 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 NOXO1Q8NFA2 376 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 OR5T1Q8NG75 326 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 OR6F1Q8NGZ6 308 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC7A13Q8TCU3 470 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF670Q9BS34 389 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC35A5Q9BS91 424 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 RBKSQ9H477 322 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 REEP4Q9H6H4 257 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ACP6Q9NPH0 428 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 TREX1Q9NSU2 369 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 CDHR2Q9BYE9 1310 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM231BA6NCW3 169 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 IDSB3KWA1 339 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 H3BN98 237 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 GFYI3L273 518 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 AQP9O43315 295 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 EMC8O43402 210 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ZMPSTE24O75844 475 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 RCBTB2O95199 551 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 TNFAIP8O95379 198 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ACTL6AO96019 429 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 FGGP02679 453 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 GPIP06744 558 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 GP1BAP07359 652 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 IVDP26440 423 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 DCTP40126 519 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 CDKN2CP42773 168 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 GSSP48637 474 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 GPX6P59796 221 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 RPS14P62263 151 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SARNPP82979 210 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 IFFO1Q0D2I5 559 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 EIPR1Q53HC9 387 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 COQ5Q5HYK3 327 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SEL1L2Q5TEA6 688 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ABHD13Q7L211 337 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 MTURNQ8N3F0 131 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF75AQ96N20 296 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-204ENST00000461653 APOL2Q9BQE5 337 aa3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms