RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	OR2M5	A3KFT3	312 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	IFNA7	P01567	189 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FBXO45	P0C2W1	286 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CRABP1	P29762	137 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	MELK	Q14680	651 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	TOMM20	Q15388	145 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	KMT5C	Q86Y97	462 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR6S1	Q8NH40	331 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	OR52N5	Q8NH56	324 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A28	Q96A46	364 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CHIA	Q9BZP6	476 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	KCNK15	Q9H427	330 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	FGF21	Q9NSA1	209 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	DHDH	Q9UQ10	334 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TOM1-210	ENST00000449058	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		15.21	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RAD1	O60671	282 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	KDM4B	O94953	1096 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GLB1	P16278	677 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FST	P19883	344 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RAP2B	P61225	183 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TSPAN5	P62079	268 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RNF4	P78317	190 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GLO1	Q04760	184 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	COX15	Q7KZN9	410 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MDGA2	Q7Z553	956 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MISP	Q8IVT2	679 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RBP7	Q96R05	134 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FREM3	P0C091	2139 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HLA-DOB	P13765	273 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PTGS2	P35354	604 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PSMA6	P60900	246 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GUCA2A	Q02747	115 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM234	Q8WY98	164 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MARVELD3	Q96A59	401 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058		A0A1W2PPC1	479 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PLSCR5	A0PG75	271 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MS4A18	H0YCH9	400 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MPZL1	O95297	269 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IL11	P20809	199 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZP4	Q12836	540 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CLLU1	Q5K131	121 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A45	Q8N413	288 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058		A6NIZ1	184 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GIMD1	P0DJR0	217 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS3	P35030	304 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RAP1B	P61224	184 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RAP1A	P62834	184 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GRK1	Q15835	563 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ASB10	Q8WXI3	467 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ST8SIA1	Q92185	356 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NPAS1	Q99742	590 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GINS4	Q9BRT9	223 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CKLF	Q9UBR5	152 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058		R4GMQ9	66 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CD2	P06729	351 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	AKAIN1	P0CW23	69 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MYF5	P13349	255 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FOXL2	P58012	376 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PCK2	Q16822	640 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	KDM8	Q8N371	416 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		15.18	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms