RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428331.6

ATP2C1-204, Transcript of ATPase secretory pathway Ca2+ transporting 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATP2C1, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1-204ENST00000428331 LINC01590Q5TEZ4 76 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNF585AQ6P3V2 769 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 RHOUQ7L0Q8 258 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 GALNT16Q8N428 558 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ACBD4Q8NC06 268 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ELP5Q8TE02 316 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNRF4Q8WWF5 429 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 OR1E3Q8WZA6 343 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 FGF13Q92913 245 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 PBX4Q9BYU1 374 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 MEMO1Q9Y316 297 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 KIAA1671Q9BY89 1806 aa9.76□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 HCRTR2O43614 444 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC16A7O60669 478 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SCGNO76038 276 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 STK17BO94768 372 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SMIM10L1P0DMW3 83 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TACR3P29371 465 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 KCNAB1Q14722 419 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC17A1Q14916 467 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 CDC20BQ86Y33 519 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 BAP18Q8IXM2 172 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNF679Q8IYX0 411 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 OR4C3Q8NH37 302 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 DNAJA3Q96EY1 480 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SMIM10Q96HG1 83 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC41A2Q96JW4 573 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 KCNG2Q9UJ96 466 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 F5P12259 2224 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TMEM235A6NFC5 223 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 PLGP00747 810 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 PET100P0DJ07 73 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SLC25A4P12235 298 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 CTSEP14091 401 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 PSMB6P28072 239 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SHEQ5VZ18 495 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SEH1LQ96EE3 360 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ZFP57Q9NU63 452 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 I3L1I5 382 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNF264O43296 627 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 AKR7A3O95154 331 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ITGA5P08648 1049 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 CASRP41180 1078 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ATP1B3P54709 279 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 S100A12P80511 92 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 PMPCAQ10713 525 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 PDZK1IP1Q13113 114 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TOMM20Q15388 145 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 GAL3ST4Q96RP7 486 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 POLR1DQ9Y2S0 133 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 A0A0B4J2A0 478 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 CYR61O00622 381 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 GP1BBP13224 206 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 PEA15Q15121 130 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TMEM52Q8NDY8 209 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 OR51A4Q8NGJ6 313 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 OTOSQ8NHW6 89 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 FOXN4Q96NZ1 517 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 OR8B4Q96RC9 309 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 LPAR4Q99677 370 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 MMP25Q9NPA2 562 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SHPKQ9UHJ6 478 aa9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 NDUFA2O43678 99 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 IL12BP29460 328 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 OR3A2P47893 321 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 NFATC4Q14934 902 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TMEM244Q5VVB8 128 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 OR10A5Q9H207 317 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 HRH4Q9H3N8 390 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 FANCFQ9NPI8 374 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.74□□□□□ -0.85
ATP2C1-204ENST00000428331 SCN5AQ14524 2016 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms