RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 AKR7A2O43488 359 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 KLRC4O43908 158 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 MGRN1O60291 552 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 SNX3O60493 162 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 SDC3O75056 442 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 PALMO75781 387 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 TM7SF2O76062 418 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 HLA-DQB1P01920 261 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 MT-ND2P03891 347 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 MT-ATP8P03928 68 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-540P-201ENST00000384622 F3P13726 295 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 HPDP32754 393 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-540P-201ENST00000384622 PGM1P36871 562 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 MYCNOSP40205 109 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR1D4P47884 311 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 STARP49675 285 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-540P-201ENST00000384622 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR4D2P58180 307 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-540P-201ENST00000384622 BSPH1Q075Z2 132 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 SCN1BQ07699 218 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC10A7Q0GE19 358 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 RALGDSQ12967 914 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 RIPK1Q13546 671 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF345Q14585 488 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 RASA2Q15283 850 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 MMDQ15546 238 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 INAQ16352 499 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 POU2AF1Q16633 256 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 IQCJQ1A5X6 159 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 PGGHGQ32M88 737 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 GFOD2Q3B7J2 385 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 BSXQ3C1V8 233 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ADPRMQ3LIE5 342 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ATF7IP2Q5U623 682 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 AP1ARQ63HQ0 302 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC8B1Q6J4K2 584 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 NEK5Q6P3R8 708 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF773Q6PK81 442 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 DHRS11Q6UWP2 260 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 FAM219AQ8IW50 185 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-540P-201ENST00000384622 GAPTQ8N292 157 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 CCDC191Q8NCU4 936 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 NAXEQ8NCW5 288 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM185AQ8NFB2 350 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR9K2Q8NGE7 335 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR52M1Q8NGK5 317 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR9A1PQ8NGU1 263 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 UBA3Q8TBC4 463 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-540P-201ENST00000384622 RSPH1Q8WYR4 309 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 UBE2E3Q969T4 207 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 GALNT14Q96FL9 552 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 TGM7Q96PF1 710 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 DUSP16Q9BY84 665 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-540P-201ENST00000384622 LRRN3Q9H3W5 708 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 SIAEQ9HAT2 523 aa-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-540P-201ENST00000384622 NEK6Q9HC98 313 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 LUZP4Q9P127 313 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
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RNU6-540P-201ENST00000384622 CDH7Q9ULB5 785 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 NENFQ9UMX5 172 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 CAMK2AQ9UQM7 478 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ERGIC3Q9Y282 383 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 SH3GLB1Q9Y371 365 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 R4GN34 69 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 ADGRB3O60242 1522 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 PLXNB2O15031 1838 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 DSCAMO60469 2012 aa-1.66□□□□□ -2.67
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRPM7Q96QT4 1865 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 CROCC2H7BZ55 1655 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 LNP1A1A4G5 178 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 TUBAL3A6NHL2 446 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC22A20A6NK97 555 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF716A6NP11 495 aa-1.66□□□□□ -2.68
RNU6-540P-201ENST00000384622 H7C2G1 150 aa-1.66□□□□□ -2.68
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