RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 RTP4Q96DX8 246 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TSSK2Q96PF2 358 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ALG12Q9BV10 488 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51B4Q9Y5P0 310 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PPC4 97 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SMCO3A2RU48 225 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM183AA6NL82 134 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC1A7O00341 560 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 UMODP07911 640 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10J4P0C629 311 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MSR1P21757 451 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ARL4DP49703 201 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP2J2P51589 502 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 IL2P60568 153 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf99Q6UX52 265 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZVU0 165 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MIER2Q8N344 545 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LPAR4Q99677 370 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF350Q9GZX5 532 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PRO3102Q9H379 93 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DDIT4Q9NX09 232 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR7A17O14581 309 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R2P9O14990 202 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CST2P09228 141 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HSD17B1P14061 328 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FAHP16930 419 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A11P48066 632 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GSK3BP49841 420 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SELENOPP49908 381 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 P2RY6Q15077 328 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM219AQ8IW50 185 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MUC15Q8N387 334 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SPICQ8N5J4 248 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 C12orf42Q96LP6 360 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZIC5Q96T25 663 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51E2Q9H255 320 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NELFAQ9H3P2 528 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OSER1Q9NX31 292 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CALML5Q9NZT1 146 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 IL17CQ9P0M4 197 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SGK494L7N484 410 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 EMC8O43402 210 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LRP3O75074 770 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 VENTXO95231 258 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MTHFD2P13995 350 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CD1DP15813 335 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SOX3P41225 446 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR3DL1P43629 444 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN12P56749 244 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF697Q5TEC3 545 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LHX8Q68G74 356 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LAIR1Q6GTX8 287 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6.16□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2T27Q8NH04 317 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR14L1PQ8NHC6 308 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 IL17FQ96PD4 163 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 DGAT2Q96PD7 388 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 SYT3Q9BQG1 590 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WUJ7 227 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CLDN24A6NM45 220 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 CDIPTO14735 213 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GIPRP48546 466 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PAX9P55771 341 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GABRA6Q16445 453 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PGGHGQ32M88 737 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.15□□□□□ -1.42
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