RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 HSF2Q03933 536 aa13.37□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP13.37□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa13.37□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 B9D1Q9UPM9 204 aa13.36□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 FOXC2Q99958 501 aa13.35□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIP2Q9C0E4 1043 aa13.35□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 RACGAP1Q9H0H5 632 aa13.35□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 CDH20Q9HBT6 801 aa13.35□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR6C68A6NDL8 312 aa13.34□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF3P17036 446 aa13.34□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 PAICSP22234 425 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 TTKP33981 857 aa13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 APLNRP35414 380 aa13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 RPS23P62266 143 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNMB1Q16558 191 aa13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 PGGHGQ32M88 737 aa13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB46Q86UZ6 589 aa13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC15Q8N387 334 aa13.34□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR10H5Q8NGA6 315 aa13.34□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO17Q96EF6 278 aa13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.34□□□□□ -0.27
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF416Q9BWM5 594 aa13.34□□□□□ -0.27
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PGGT1B-202ENST00000379615 CMC2Q9NRP2 79 aa13.34□□□□□ -0.27
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